畜禽遗传评估(2)母体遗传效应

郭军 2016-10-6 10:33

畜禽一些重要经济性状，比如体重，受母本遗传效应影响。母体遗传方差占比较小，然而如果不将其从表型方差中剖分，会导致加性遗传方差估值偏高，进而影响育种值排序。 解析母体遗传效应的模型比较简单，唯一值得考虑的是母体遗传与加性遗传是否存在协方差。有的学者认为，两者之间的协方差是统计误差或群体层化，可以忽 ...

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畜禽遗传评估(1)两性状随机回归模型

郭军 2016-9-20 16:05

有些性状可以重复测量，例如身高，可以每隔半年测一次，也可以每天测一次，只要你不嫌烦 这类多次测量的性状称为动态性状，也称经向性状（longitudinal traits）。动态性状在统计处理时以自身为对照，利于减少环境误差、提高统计效率（power）。畜禽遗传评估时经常遇到动态性状，例如奶牛产奶量、蛋鸡产蛋数、山羊绒长度、 ...

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R: 遗传相关系数

郭军 2016-9-14 14:26

【cov2cor】,以前用过这个命令，今天想用时忘记了，把R和matlib折腾半天，没有结果 只好在excel手动计算，太费事。 网上搜索，在wiki重新得到这个命令。 顺便鄙视baidu，太垃圾，还是google好。

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以ggplot2绘制GWAS中染色体遗传力与长度回归图

郭军 2016-1-6 15:11

script如下： data - read.table(chrome_bs.csv,header=T,sep=,) #csv文件有标题行，至少含两列数据染色体长度（size）和染色体遗传力（h2） library(ggplot2) tiff(chrome_bs.tiff,height=1600,width=2400,res=300,compression=lzw) ggplot(data,aes(gene,bs))+geom ...

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福昕的搜索功能真强啊

郭军 2015-5-21 14:33

据传，福昕曾被列入不安全软件，于是一段时间将其闲置一旁。今天发现福昕PDF阅读器搜索功能很强大，可以搜索指定文件夹内所有pdf文件，真的不错！

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R软件包ggplot2的安装

郭军 2015-4-22 11:17

论文写作需要使用ggplot2，尝试安装不成功。于是，上网搜索一番后，仍然无法正确安装。 静下心来，重新看了看安装时的错误提示。发现依存的环境没有设定好，需要plyr、reshape2以及scale软件包。 重新用rstadio安装plyr，仍然不成功。下载最新版源代码安装，显示plyr在R 3.1以上运行。原来问题出在这里，我的R版本是3.0. ...

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