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R| 遗传评估| 序列编辑| 其它|
解决Rstudio中文乱码问题
郭军 2021-5-23 18:40
最近更新了Rstudio，发现新版本无法正常显示、处理csv文件中文字符。 网上寻找解决方法，无果。 后来，将csv文件转换成xls或xlsx文件。从file导入后，可以正常显示、处理了。请注意，文件夹以及文件名不能使用中文。 对应的script如下： library(readxl) eggquality - read_excel(eggquality.xls) Vie ...
个人分类: R|3680 次阅读|没有评论
R: 遗传相关系数
郭军 2016-9-14 14:26
【cov2cor】,以前用过这个命令，今天想用时忘记了，把R和matlib折腾半天，没有结果 只好在excel手动计算，太费事。 网上搜索，在wiki重新得到这个命令。 顺便鄙视baidu，太垃圾，还是google好。
个人分类: R|2548 次阅读|没有评论
以ggplot2绘制GWAS中染色体遗传力与长度回归图
郭军 2016-1-6 15:11
script如下： data - read.table(chrome_bs.csv,header=T,sep=,) #csv文件有标题行，至少含两列数据染色体长度（size）和染色体遗传力（h2） library(ggplot2) tiff(chrome_bs.tiff,height=1600,width=2400,res=300,compression=lzw) ggplot(data,aes(gene,bs))+geom ...
个人分类: R|3290 次阅读|没有评论
R软件包ggplot2的安装
郭军 2015-4-22 11:17
论文写作需要使用ggplot2，尝试安装不成功。于是，上网搜索一番后，仍然无法正确安装。 静下心来，重新看了看安装时的错误提示。发现依存的环境没有设定好，需要plyr、reshape2以及scale软件包。 重新用rstadio安装plyr，仍然不成功。下载最新版源代码安装，显示plyr在R 3.1以上运行。原来问题出在这里，我的R版本是3.0. ...
个人分类: R|18025 次阅读|没有评论

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