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一种抗感染性疾病药物的启发式发现方法及其在治疗新型冠状病毒肺炎药物发现中的应用初探
2020-9-27 09:22
摘要 目的 建立一种抗感染性疾病药物的启发式发现方法(aCODE方法),以用于抗感染性疾病药物研发。 方法 选择美国食品药品监督管理局(FDA)批准药物数量≥40个的5种感染性疾病(艾滋病、流行性感冒、副黏液病毒感染、细菌性感染和百日咳),每种疾病设实验组和2个阴性对照组(A和B),实验组 ...
个人分类: 网络药理学|1911 次阅读|没有评论
microRNAs作为网络化治疗策略的特色
2012-6-14 18:40
microRNAs 作为当前癌症领域一种全新的靶向治疗、网络化治疗治疗策略,治疗性 microRNAs 代表了一种全新的药物开发品种,目前大量在其给药途径、临床前毒性研究方面进展迅速 。作为新型靶向治疗策略, microRNAs 的优势非常明显: (1) &nbs ...
个人分类: 网络药理学|4774 次阅读|没有评论
遗传相互作用(协同致死)在药物组合设计、个体化治疗方面的应用
2012-6-14 18:38
遗传相互作用(协同致死)在药物组合设计、个体化治疗方面的应用
遗传相互作用(协同致死)可用于开发药物组合、设计靶向治疗、设计个体化治疗策略: 首先,遗传相互作用可以用于药物组合的设计。例如,Whitehurst等人针对药物紫杉醇(paclitaxel),利用协同致死筛选实验筛选得到87个与紫杉醇的作用位点(细胞内微管的动态过程)具有协同致死效应的基因,对这些基因的 ...
个人分类: 网络药理学|7881 次阅读|没有评论
用于药物筛选的网络模型--生物信息学的新玩法
热度 2 2011-2-6 18:11
近日有做生物信息学(系统生物学)的朋友读到我们近期发表的论文 Pre-Clinical Drug Prioritization via Prognosis-Guided Genetic Interaction Networks(全文) ,问到:怎么想到建立一个基因网络模型来作药物筛选?好像以前没有见到类似的研究命题啊? 可能确实这种玩法比较新颖,现将有关回应贴到这里: ...
个人分类: 网络药理学|5947 次阅读|1 个评论 热度 2
维度创新-带来药物作用机制研究的新视角(RNAi)
热度 1 2011-1-19 11:02
Nature Chemical Biology 的一篇新论文提出了一种全新的刻画药物作用机制的方式,用RNAi技术产生一系列细胞系,用药物对这些细胞系的“response signature”来反映药物对细胞的作用特征。通过与已知药物“response signature”的相似性搜索,可以预测和鉴定新药物的作用机制(mechanism of action)。 (原文: A mamm ...
个人分类: 网络药理学|4999 次阅读|1 个评论 热度 1
网络药理学 概论
热度 2 2011-1-15 09:14
现代基因组学、蛋白质组学、代谢组学等“组学”的发展,以及系统生物学视角的引入、创新的生物信息学工具的研究开发,极大地促进了对于 药物作用机制(Mechanism of Action, MOA) 的研究,并发展出一系列标志性的、创新的研究范式(paradigm)。现代化学生物学(chemical biology)的发展,积累了海量的关于小分子化合物的细 ...
个人分类: 网络药理学|24311 次阅读|2 个评论 热度 2
如何进行药物组合(配伍)?-基于网络药理学的途径
2011-1-15 09:04
为了试图建立药物组合的理论与原则,我们提出了“条件组合”的思路。即给定药物a为有效药物的前提下,如何筛选与之有最大协同增效、或减毒作用的药物b,以药物a、药物b组合效果优于单独的药物a,或单独的药物b为筛选原则。由于前述我们建立的基因网络本身就是基因之间协同作用的网络,因此可以直接用于药物组合的筛选。( ...
个人分类: 网络药理学|8313 次阅读|没有评论
基因网络中“行政领导”比“明星”更重要
热度 1 2011-1-11 13:14
重读Science Signaling上近期发表的论文Rewiring of Transcriptional Regulatory Networks: Hierarchy, Rather Than Connectivity, Better Reflects the Importance of Regulators,如果将Hierarchy上的重要节点比作行政领导,将Connectivity上重要节点比作明星(有 ...
个人分类: 网络药理学|6060 次阅读|2 个评论 热度 1

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