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使用MutMap快速定位突变基因：实战篇

热度 1 2018-3-27 17:25

通过前面两篇文章对MutMap原理和分析流程的介绍，我们对MutMap的分析已经有了比较深入的了解，是时候来点儿数据实战一下了！ MutMap的发明者已经搭建好了一套Pepline，并写好了MutMap pipeline framework供大家免费使用。我们只需要将数据按照要求进行放置和命名，并通过非常简单的几个命令，将任务提交给服务器，经过三 ...

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使用MutMap快速定位突变基因：流程篇

2018-3-26 17:53

在上一篇文章《使用MutMap快速定位突变基因：原理篇》中，我对MutMap的原理进行的简单的介绍。在本篇教程中，我会对MutMap分析的流程及分析过程中使用到的软件及其参数的设置进行逐一的分解，以求对MutMap的分析流程有更深入的理解。 1.对重测序数据进行质控，挑出高质量的reads （1）使用软件：FASTX-Toolkit ① f ...

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使用MutMap快速定位突变基因：原理篇

2018-3-25 23:05

缘起 在我的课题中，我们使用了BSA结合全基因组重测序的方法寻找候选基因。本人乃生信小白一枚，可是对生物信息学非常感兴趣，一直想学一些生信分析。索性就以此为切入点，开始了自学生信的漫漫长路。从最简单的Linux操作，到生信软件的安装和使用，又学了一点Perl、Python和R的语法，花费了近两个月的课余时间（主要是 ...

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