Shell编程之运算符

曹务强 2017-12-7 23:46

1.declare命令：声明变量类型 在Linux系统中，默认的变量类型是字符串型，我们不能进行正常的加减运算。而当我们要对数值进行运算时，可以使用declare命令，声明变量的类型。 使用方法： declare 选项解释： -：给变量设定类型属性 +：取消变量的类型属性 -a：将变量声明为数组型 -i：将变量声明为 ...

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Linux编程之变量1：bash变量与变量分类-1

热度 1 曹务强 2017-12-5 23:15

1.什么是变量 变量是计算机内存的单元，其中存放的值可以改变 变量让你能把编程中准备使用的每一段数据，都赋给一个简短、易于记忆的名字 简单说，变量就是一个名称，用来给我们在编程中需要使用的数值命名，当我们需要使用这个数值时，我们直接调用变量名称即可。就像我们每一个人都有一个独特的名字，当我们要叫这 ...

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Shell基础-2：脚本执行方法

曹务强 2017-12-2 22:56

1.echo输出命令 echo 该命令用于将内容输出到屏幕上 选项： -e：支持反斜线控制的字符转换，主要用来调整输出格式 -e选项支持以下字符转换格式： 举个例子： yjjh@yjjh:~$ echo Hello,World #打印 Hello,World yjjh@yjjh:~$ echo -e Hel\tlo,\nWor\tld Hel lo, Wo ...

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Shell基础-1：Shell概述

曹务强 2017-12-1 00:09

在生物信息学分析过程中，我们经常会使用Shell编写一些脚本，以便执行程序化的分析。因此，我们有必要对Linux下的Shell语法进行学习和了解，一方面可读懂别人写的Shell脚本，另一方面也可以自己编写一些脚本，以提高效率。 1.什么是Shell Shell是一个命令行解释器。它为用户提供了一个向Linux内核发送请求以便运行程序 ...

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生物信息软件安装3：安装预编译版本的BLAST

曹务强 2017-11-16 23:17

由于我国特殊的网络环境，有时候我们通过conda无法顺利下载和安装生信软件，我们必须还得熟悉传统的软件安装方式，以备不时之需。 传统的软件安装方式包括：安装预编译版本的软件和从源代码安装软件。由于从源代码安装软件的编译过程非常缓慢，一般情况下优先安装预编译版本。 1.从ftp下载预编译版本的BLAST安装包 ...

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生物信息学软件安装2：使用Bioconda管理生信软件

曹务强 2017-11-15 23:37

在苹果操作系统上，我们可以从App Store下载各种软件。Linux操作系统有没有一个类似于App Store的平台，可以使我们非常方便的下载各种软件，而不用考虑各种依赖包的问题呢？答案当然是肯定的，就是我们今天要介绍的Bioconda。 要介绍 Bioconda 首先得介绍一下Anaconda： Anaconda指的是一个开源的Python发行版本，而Bio ...

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Linux入门4：用户和权限管理

曹务强 2017-11-13 23:25

1.什么是用户管理和权限管理 用户管理 ：用户管理据定了有多少人共同使用一台Linux服务器，以及这些用户之间如何分组 权限管理 ：权限管理设定某些数据或软件哪些人可以修改或使用，即设定热门对文件或软件的操作权限 用户管理和权限管理保证了多个人同时使用同一台Linux服务器时的安全和高效。 2.用户管理 Linux ...

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