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38个水稻全基因组序列
闫双勇 2020-11-25 19:06
我搜集的水稻基因组序列,如果有新序列出来,请告诉我下 16个下面这篇文章提到的水稻基因组 2020 A platinum standard pan-genome resource that represents the population stru.pdf 包括这些品种: Azucena_GJ-trop1 IR64_XI-1B1 IRGC_109232-1_XI-3B2 IRGC12485_cB IRGC132424_XI-2A IRGC19961_GJ-trop2 I ...
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监控有水稻序列的文献
热度 1 闫双勇 2013-7-24 00:50
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非常好的图示基因型软件
热度 1 闫双勇 2012-6-23 22:31
http://bioinf.hutton.ac.uk/flapjack/ 这个软件能显示高通量基因型数据,能在windows下运行,学习中. 这是参加中国农业科学院主办的"GCP挑战计划中国育种家开放日活动"的一个收获,当然它都没提到这个,但他提到个网站:https://www.integratedbreeding.net/ib-tools/field-trial-managemen ...
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水稻基因组100k
闫双勇 2012-6-22 10:59
每100k水稻基因组里都有些什么?刚发现了SQL查询函数的一个有意思的功能,所以能很快的给出一组统计数据.这个数据可以为在精细定位的时候进行分子标记开发提供参考.因为它可以告诉你100k内有多少DEL和Insert,有几个非转座子编码基因. tigrv5_100k.xlsx 参考基因组序列为tigrv5.这是一个让 ...
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水稻基因表达及passway分析
热度 1 闫双勇 2012-1-9 15:20
http://ricexpro.dna.affrc.go.jp/index.html Keyword search Enter RAP locus ID , Accession number, or gene name. http://pathway.gramene.org/RICE/new-image?object=Biosynthesis
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水稻基因表达分析网站
闫双勇 2011-12-23 16:12
http://www.ricearray.org/expression/expression.php 这个网站,关于表达的数据比较多 Number of experiments in database: 62 Number of samples/hybridizations in database: 1155
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水稻Os,lOC编号基因对应表
热度 1 闫双勇 2011-12-21 19:00
http://rapdb.dna.affrc.go.jp/archive/build4.html Annotation data on IRGSP build 4 genome sequence Table of the Os code and MSU's LOC_Os (gz file, 0.6MB) Annotation data on IRGSP build 5 genome sequence http://rapdb.dna.affrc.go.jp/download/index.html Table of RAP and MSU's LOC_O ...
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已经发表的植物SNP数据(关联作图)
闫双勇 2011-12-1 21:50
http://www.gramene.org/diversity/tassel_launch.html LAUNCH TASSEL with SNP data setsClicking on a link below will launch TASSEL 3.0-beta with one or all chromosomes. Your computer must have Java 6 installed. Maize Maize Diversity Hapmap1, AGPv2 coordinates ...
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水稻籼粳间多态性基因
热度 1 闫双勇 2011-5-28 17:58
这是我的SQL数据库里弄出的一点东西,对开发分子标记可能有用.籼稻品种为9311,粳稻品种为日本晴.数据原始来源为tigr version 5,也就是说基因所在染色体位置应该按这个版本.这和上篇博文SSR标记的序列版本是 不 一样的. bioysy水稻基因组多态性基因.rar 不过,如果把上面 ...
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水稻SSR标记
热度 4 闫双勇 2011-5-25 22:43
Sequencing ProjectInternational Rice, G. (2005). The map-based sequence of the rice genome. Nature 436, 793-800. the map-based sequence of the rice genome.pdf 这篇文章有个附件,附件里有水稻SSR标记的引物序列,这个序列可以拿去直接合成引物 完整的表在附件中.这个SSR的预测是基于 ...
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