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安装包org.Hs.eg.db失败及解决
闫双勇 2020-12-21 13:03
利用这个命令安装: BiocManager::install(org.Hs.eg.db) 提示信息: URL 'http://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/3.12/data/annotation/src/contrib/org.Hs.eg.db_3.12.0.tar.gz': Timeout of 60 seconds was reached Warning in download.packages(pkgs, destdir = tmpd, available = available,&nb ...
个人分类: 技术和方法|13814 次阅读|没有评论
PDF文件的分割及合并方法
闫双勇 2020-11-24 20:52
昨天有同事提的需求:把一个pdf文件中的几页提取出来,生成新的pdf文件。以前干过这种事,不过时间一长就会忘记,写到这里,如果有需求下次来查。 我用的是ubantu系统,如果您的系统是windows,下面的方法不适用。 修改一下下面这段代码就可以搞定: #把要分割的 ...
个人分类: 技术和方法|2432 次阅读|没有评论
基因组编辑技术(genome editing technology)
热度 1 闫双勇 2014-4-21 00:33
这个技术可能是现在及今后比较长的一段时间的研究及应用的热点技术。最新和最有代表性的是: CRISPR-Cas genome editing technology。“ In the past 18 months, over 125 papers on the technology have been published. At least three commercial ventures have been founded around the platform. ”( ...
个人分类: 技术和方法|10816 次阅读|1 个评论 热度 1
《自然》解码美基因组测序新“神器”-简评
热度 2 闫双勇 2014-1-22 00:22
新闻链接: http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2014/1/287752.shtm 这个,比起转基因对生命科学的研究及整个社会的影响要大多了。分子育种的黄金时代可能正在悄然而至,我在想10年以内,定位是否还需要做大量的PCR或者还会不是做PCR?当更加简单、高效的方法,成本降低到足够低的程度 ...
个人分类: 技术和方法|3402 次阅读|4 个评论 热度 2
略论定点突变
热度 2 闫双勇 2014-1-19 23:19
今年的国家自然科学基金估计会有不少本子会涉及到这个技术,简单说几句. 1 这个技术本质上是一种反向遗传学的技术,也就是说,是从序列出发的,由序列出发到序列的功能,或者是由序列出发.考虑这段序列的应用.前段时间参与一个讨论,想从性状(或者是表型)的角度出发,应用这项技术,如果从育种的角度 ...
个人分类: 技术和方法|3383 次阅读|3 个评论 热度 2
变异效应预测工具Variant Effect Predictor
闫双勇 2013-12-1 19:35
http://www.gramene.org/tools.html
个人分类: 技术和方法|6197 次阅读|没有评论
CRISPR系统的缺点
闫双勇 2013-11-13 04:33
http://www.biotechniques.com/news/CRISPR-Less-Reliable-Than-Alternatives/biotechniques-344342.html?utm_source=BioTechniques+Newsletters+%26+e-Alertsutm_campaign=13fa3a5901-Genomics_05122011utm_medium=emailutm_term=0_5f518744d7-13fa3a5901-86762166#.UoKO3bIcaTU 较高频率的非靶位点变异. ...
个人分类: 技术和方法|4740 次阅读|没有评论
高通量测序新进展
闫双勇 2013-10-19 22:14
Pseudo-Sanger sequencing: massively parallel production of long and near error-free reads using NGS technology ( http://www.biomedcentral.com/1471-2164/14/711/abstract )
个人分类: 技术和方法|3028 次阅读|没有评论
快速建立DH系的方法
闫双勇 2013-9-27 01:02
Rapid creation of Arabidopsis doubled haploid lines for quantitative trait locus mapping http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22371599
个人分类: 技术和方法|4733 次阅读|没有评论

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