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Linux互信登录
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2010-12-11 22:00
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药物设计中许多软件(如Gold,MOE/smp)都需要不同主机之间的无密码互信登录才能利用Cluster中的计算资源(有些软件也可以用命令行中加入明文密码的方式,但是繁琐而且不安全)。 实际上建立ssh无密码互信登录相对比较容易,按照网上的教程操作即可。 1、每台机器都mkdir ~/.ssh; cd ~/.shh;ssh-keygen -t rsa ...
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个人分类: Linux|4222 次阅读|没有评论
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PVM的安装
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2010-12-2 21:09
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很多软件需要PVM作为并行环境,如Gold分子对接软件。PVM的安装十分简单。 下载tar.gz包后,tar xzf pvmX.X.tar.gz 解压。 将pvm目录拷贝到目标目录,如~/.bin (个人的主目录,一般管理员达人没有安装的话,咱就不麻烦他了) 设置环境变量(csh) setenv PV ...
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个人分类: Linux|5673 次阅读|没有评论
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注意Java版本
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2010-11-25 20:37
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如果你在下载PDB数据库或者使用某个软件的时候遇到文件丢失,比如下载已提示成功完成,可是你就是找不到文件。或者你在某个软件(涉及到版权,就不举例了)中,明明在一个文件夹中可以看到这个软件生成的几个文件,而用浏览器却看不到这些文件(并非隐藏或系统文件)。你可以考虑升级你的Java了,兴许可以解决问题。 ...
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个人分类: 科研随笔|2906 次阅读|没有评论
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《分子模拟与药物设计》课程主线
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2010-11-1 16:23
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这学期给研究生讲《分子模拟与药物设计》,附件是前三章的主线图,供参考(这个博客的图片上传后都不清楚,所以以后就附件吧) 小节没有编号,按照顺时针的顺序阅读即可。 第一章 概述 第二章 药理学基础与药物设计理论基础 第三章 化学信息学与药物设计
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个人分类: 药物设计|4605 次阅读|没有评论
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学术会议主题应适当集中
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2010-11-1 10:58
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今天有个同事询问要不要参加一个在厦门召开的学术会议,由于该会议和我方向有些差异,就决定不去凑热闹了。不过,这提醒了我,应该查看一下2011年有什么合适的学术会议,别错过了学习的好机会。就Google了一下,发现包含我感兴趣方向的会议很多,但是切中主题的会议很少。 现在各种会议越来越多,什么 ...
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个人分类: 科研随笔|3368 次阅读|4 个评论
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Corina简介
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2010-10-26 21:32
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Corina 简介 Corina 软件由德国 Erlangen-Nuremberg 大学有机化学研究所的 Gasteiger 研究组开发,现由德国 Molecular Networks 公司发行,主要用于分子三维结构的生成,同时该软件还可以作为一款结构转化软件来使用。 Corina 的命令格式为(举例): corina i t=sdf &ndash ...
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个人分类: 药物设计|7778 次阅读|没有评论
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SYBYL的主要模块归类
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2010-10-15 21:52
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个人分类: 药物设计|4391 次阅读|1 个评论
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UNIX/Linux 常用的指令
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2010-10-4 22:27
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a) 文件管理 1. ls ...
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个人分类: Linux|4581 次阅读|1 个评论
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Linux 常用技巧(随笔)
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2010-10-4 22:21
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1、关闭PC喇叭 在Linux下工作的时候(或windows下远程使用),常常碰到系统PC喇叭发声,尤其是半夜,十分讨厌,可使用管理员账户: 临时措施: rmmod pcspkr 或者xset b off 永久修改: /etc/modprobe.d/blacklist 中增加一行 blacklist pcspkr 附windows方案: 【设备管理器】 ...
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个人分类: Linux|4841 次阅读|没有评论
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