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修结构新得

已有 5107 次阅读 2010-5-30 11:33 |个人分类:未分类|系统分类:科研笔记| 修正, 心得, 蛋白结构, 拉氏构象图

今天还在修第一轮结构,四聚体,现在在修第四条链了。新手乍练,有些心得,share一下。也希望有各位大牛飘过,指点一二。^_^

修结构的时候发现 侧链越大的氨基酸残基越容易在密度中找到正确的位置.

出问题最多的就是ALA GLY 和pro 密度很细 肉眼分辨不出来正确的走象。

PRO 和Gly总是出现在拐角处,而拐角处的密度又往往是多方交集 乱的很~ 拉氏构象图上的红点多是这种位置。

cys处也容易出红点。

还有 alpha 螺旋和beta 折叠内部一般不会出什么问题。

待续。。。^_^



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1 张旭

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