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关于配位聚合物的配位共价键以及配体荧光性质分析: 丁宝童 2022-2-16 22:56; 一、价键分析目前关于主流价键分析方法主要包括两类：一类是AIM分析；另外一类即是键级分析。 AIM分析全称为Atoms in Molecules，主要涉及三个参数。键临界点（BCP）处的电子密度和势能密度 ρ(BCP)和V(BCP) 以及电子密度的拉普拉斯函数 ▽2ρ(r) 。一般我们认为当 ρ(BCP)越大和V(BCP) 越负，对于同类化 ...; 3710 次阅读|没有评论

OLEX晶体在解决无序时的基本操作: 热度 1 丁宝童 2021-12-26 22:19; 申明：以上非我本人所创。我是从DJ_TOKYO那总结的同个位置被不同类型的原子占据，主要是发生在以无机晶体结构中或者是在有机晶体中由于配体的纯度不够，导致发生置换无序。不过我们今天聊的主要是位置无序。位置无序主要是一个原子或者某个官能团占据的位置不止一个的这种现象称为位置无序。位置无序主要是有两方 ...; 7840 次阅读|1 个评论热度 1

谈一谈MOF类材料孔径计算以及孔隙率计算: 丁宝童 2021-12-13 10:07; 孔隙计算目前有五种软件可以实现，分别为platon、MERCURY、Material studio、poreblazer以及Zeo++。但是其计算所用的模型不一样，其结果也不一样。据我所知，在计算孔径时有两种模型，其分别为“solvent accessible volume”以及“contact volume”。platon、MERCURY、Material studio所用的模型为c ...; 7735 次阅读|没有评论

荧光检测中电子转移中仅仅需要分析HOMO 和LUMO吗？: 丁宝童 2021-12-12 11:20; 荧光检测中电子转移引起的荧光增强和猝灭的过程被称之为 Photoinduced electron transfer，也就是我们所说的PET过程。他是由于配合物或者是分析物在特定波长光的激发下，电子从配合物转移至分析物——猝灭，或者是分析物转移至配合物——增强。目前，分析这种转移过程我们通常计算出配合物以及分析物的HOMO LUMO,根据 ...; 4835 次阅读|没有评论

[转载]谈一谈VMD绘制分子表面静电势中一些脚本文件的作用: 丁宝童 2021-12-12 11:14; SPiso.bat ：用于产生电子密度和静电势的 cube 文件，即 density .cub 和 ESP .cub ESPpt.bat ：用于产生分子结构和表面顶点的 pdb 文件，即 mol .pdb 和 vtx .pdb ESPext.bat ：在 ESPpt.bat 基础上，还会额外产生分子表面静电势极值点的 pdb 文件（ surfanalysis.pdb ） ESPiso.txt 、 ESPpt.txt 、 ESPext. ...; 3546 次阅读|没有评论

读硕之感: 热度 1 丁宝童 2021-12-12 11:05; SS-2 平均局部离子化能.jpg 三年的读硕生涯即将结束，想想自己的科研历程真的感概万千。当然，这也是一篇求博的文章。我的方向是新型MOF材料的合成以及荧光性质分析。读硕三年，我学会了单晶解析，现在课题组的单晶的疑难问题全部由我解决。在此我非常感谢我的导师给我报了一个培训班，真 ...; 3551 次阅读|3 个评论热度 1

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