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前记:蝙蝠可能是多种人兽共患病的来源,但蝙蝠也是地球生态系统中不可或缺的重要组成部分,而且蝙蝠是目前处于濒危状态需要重点保护的物种。应正确认识新冠病毒、狂犬病毒和其他多种病毒与蝙蝠的关系,应在科学认识和有效控制病毒性传染病的同时,进一步加强对蝙蝠的保护。蝙蝠现在比以往任何时候都更需要我们的保护。
本文通讯作者Edward C Holmes 是国际著名进化生物学家和病毒学家,澳大利亚科学院院士,悉尼大学研究员和教授 ,也是上海复旦大学的荣誉客座教授。本文发表在本月最新出版的国际专业杂志《 Current Opinion in Virology(病毒学时论)》上。本博客将陆续摘要译介此文的内容。
本文的目录:
一)引言
二)蝙蝠的病毒基因组的多样性
三)与蝙蝠有关的值得注意的人兽共患病的暴发
1)冠状病毒科(Coronaviridae)
2)副粘病毒科(Paramyxoviridae )
3)弹状病毒科(Rhabdoviridae)
四)为什么蝙蝠能成为众多病毒的储存宿主?
五)蝙蝠病毒基因组的挑战
六)结论——蝙蝠的未来尚难以预测
二)蝙蝠的病毒基因组的多样性(Virome diversity in bats)(续)
宏基因组研究得出的一个广泛结论是,蝙蝠可能特别容易携带通常与人兽共患病相关的病毒科(families)的病毒。在NCBI/GenBank数据库中超过16,600个蝙蝠相关病毒序列中,85%是RNA病毒,其中30%和24%分别来自冠状病毒科( Coronaviridae)和弹状病毒科(Rhabdoviridae),而迄今确定的所有蝙蝠相关病毒序列中,10%来自副粘病毒科( Paramyxoviridae)(图1)。
有趣的是,可能造成人兽共患病更大风险的病毒科(即冠状病毒科、副粘病毒科和弹状病毒科;见下文),与那些不太可能在人类中出现的病毒科(如星状病毒科、呼肠孤病毒科和小核糖病毒科)相比,通常只与较少的几个蝙蝠科相关(图2)。
图2. 每个蝙蝠科可公开获取的病毒基因组序列的数目。
此图显示了按病毒科分离的 (a)RNA病毒数量和 (b) DNA病毒数量,以及NCBI数据库中给出的相应的蝙蝠宿主所归属的科。病毒序列的蝙蝠宿主如果未具体分类(即宿主仅列为翼手目),则标记为“未分类的翼手目(unclassified Chiroptera)”。
作为一个例子,从来源于中国和东南亚部分地区的蝙蝠样品中通过mNGS(宏基因组学下一代测序)鉴定出一系列与SARS-CoV-2(新冠病毒)相关的冠状病毒。蝙蝠携带的病毒在属于不同科的蝙蝠之间也明显不同(图2)。正如所料,与包含的物种较少的蝙蝠科[兔唇蝠科(Noctilionidae)、长腿蝠科(Natalidae)、吸盘蝠科(Myzopodidae)和烟蝠科(Furipteridae)]相比,分布广泛和物种丰富的蝙蝠科[即蝙蝠科(Vespertilionidae),菊头蝠科(Rhinolophidae),叶口蝠科(Phyllostomidae)和蹄蝠科(Hipposideridae)]中携带的病毒具有更大的多样性。
(未完待续)
参考文献:
Kate Van Brussel and Edward C Holmes,Zoonotic disease and virome diversity in bats,Current Opinion in Virology,Volume 52, February 2022, Pages 192-202,https://doi.org/10.1016/j.coviro.2021.12.008
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