Alpha多样性

林国鹏 2021-1-12 00:33

Alpha多样性（样本内多样性） Alpha多样性是指一个特定区域或者生态系统内的多样性， 常用的度量指标有Chao1 丰富度估计量（Chao1 richness estimator） 、 香农多样性指数（Shannon diversity index）、 辛普森多样性指数（Simpson diversity index）等。 计算菌群丰度：Chao； 计算菌群多样性 ...

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双歧杆菌blast本地教程

林国鹏 2021-1-10 15:46

blastn -query 2-BIF-GROEL-F_B12.fatsa -db Bif_groEL_db -out 2-BIF-GROEL-F_B12.txt -outfmt 7 -evalue 1

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