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lammps相关软件篇

已有 4252 次阅读 2021-4-10 10:07 |个人分类:lammps|系统分类:科研笔记

1.Avogadro软件

Avogadro是先进的分子编辑器和可视化工具,旨在用于计算化学,分子建模,生物信息学,材料科学及相关领域中的跨平台使用。它提供了灵活的高质量渲染和强大的插件体系结构。该软件最重要的功能是:

  • 跨平台:适用于Windows,Linux和Mac OS X的分子构建器/编辑器。

  • 免费,开源:易于安装,并且所有源代码和文档都可以修改或扩展。

  • 国际性:翻译成中文,法文,德文,意大利文,俄文,西班牙文等,还有更多语言可供选择。

  • 直观:专为学生和高级研究人员而设计。

  • 快速:支持多线程渲染和计算。

  • 可扩展:开发人员的插件架构,包括渲染,交互式工具,命令和Python脚本。

  • 灵活:功能包括Open Babel导入化学文件,为多个计算化学软件包,晶体学和生物分子生成输入。

Avogadro 1.2.0的屏幕截图。

下载
Avogadro是作为免费软件分发的。可以在此处下载适用于Windows,Linux和MacOSX操作系统的当前版本 

引文
优选的方式来引用阿伏伽德罗是:
Hanwell, M. D., Curtis, D. E., Lonie, D. C., Vandermeersch, T., Zurek, E., & Hutchison, G. R. (2012). Avogadro: an advanced semantic chemical editor, visualization, and analysis platform. Journal of Cheminformatics, 4(1), 17. doi:10.1186/1758-2946-4-17.

2. ArgusLab软件

ArgusLab是Windows操作系统的分子建模,图形和药物设计程序。现在有点过时了,但仍然很受欢迎。迄今为止,下载量> 20,000。ArgusLab是免费许可的。您不需要签署任何东西。如果要教学生使用ArgusLab可能会受益的课程,则可以根据需要使用任意数量的副本。除ArgusLab官方网站外,您不得从其他网站或来源重新分发ArgusLab。目前正在进行一项低调的工作,以将ArgusLab移植到iPad。

下载
ArgusLab是作为免费软件分发的。可在此处下载Windows操作系统的当前版本 

The preferred way to cite Avogadro is :
Hanwell, M. D., Curtis, D. E., Lonie, D. C., Vandermeersch, T., Zurek, E., & Hutchison, G. R. (2012). Avogadro: an advanced semantic chemical editor, visualization, and analysis platform. Journal of Cheminformatics, 4(1), 17. doi:10.1186/1758-2946-4-17.






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