LAMMPS安装及运行手册

1.     LAMMPS安装

（1） 单核串行安装

搜索lammps官网https://lammps.sandia.gov/，点击Download进入下载界面。

因为是在windows系统上安装LAMMPS，所以我们选择Pre-built Windows executables 进行下载。进入到Pre-built Windows executables后会出现以下下载页面：

这里我们选择Latest stable versions稳定版本。打开稳定版本后会出现以往所有的软件包。

在这里有两种应用程序，分别是  LAMMPS-64bit-stable.exe 和 LAMMPS-64bit-stable-MPI.exe；这两个的区别是LAMMPS-64bit-stable.exe是单核串行计算，一般的笔记本电脑和台式电脑都可以安装使用；LAMMPS-64bit-stable-MPI.exe是多核并行计算，主要是安装在服务器上使用。为了使用过程中不出错，我们选择同一时间段的两个安装程序下载。

下载完成后直接双击安装即可，安装完毕后桌面不会出现程序的快捷图标。

（2） 多核并行安装

1lammps安装

按照（1）中的下载介绍，下载LAMMPS-64bit-stable-MPI.exe双击步骤1中下载.exe文件，进行安装，选择想要安装的文件夹，哪个盘都可以，知道安装结束，速度很快的；此时，lamms安装告一段落。

安装完成后，打开安装位置会有一个Example文件夹，我们以文件夹里面的crack为例讲述怎样运行LAMMPS。

2MPICH2并行程序安装

在lammps官网：http://rpm.lammps.org/windows.html.lammps的页面下，有对应的32位和64位mpich2-1.4.1p1-win-ia32.msi和mpich2-1.4.1p1-win-x86-64.msi，自行下载；下载完成后进行安装；

首先，确保你是管理员身份登录的电脑，并且该用户登录时设置了密码。检查管理员身份的方法是：右键“我的电脑”—选择“管理”—弹出对话框“计算机管理”—选择本地用户和组—双击“用户”，可以设置密码和管理权限，切记不要勾选“账户已禁用”；

其次，设置完管理员权限和密码以后，在电脑“开始”菜单输入cmd，电脑列出cmd选项，右键选择文件所在位置，这时会转到cmd的快捷方式，选中cmd快捷方式，右键选择文件所在位置，找到cmd的原始位置，然后复制cmd至mpich2的.msi文件所在文接着，右键cmd文件，选择以管理员身份运行，直接键入msiexec /i xxx(xxx为下载的.msi的文件名，也就是上面1中所列的msi的名称)，此时会弹出安装对话框，接下来的步骤需要选择for everyone选项，不是just for me，设置想要安装的文件夹即可；此时需要添加lammps安装目录下的bin文件所在路径和mpich2安装目录下bin文件所在路径到电脑的环境变量中；

最后，设置完路径以后，再次复制cmd的原始文件到mpich安装目录的bin文件下，以管理员身份运行cmd，分别输入以下命令：smpd -install ，等待smpd安装完成。

至此，lammps和mpich均已安装成功。

2.运行

（1） 单核串行运行

第一步：首先在F盘下新建一个名为lammps的文件夹，其次在安装位置找到bin文件夹，把bin文件夹里面的lmp_serial.exe这个运行程序复制到F盘下的lammps文件夹中。

第二步：如果运行crack这个示例，那么你需要把crack文件夹下的in.crack文件复制到F盘下的lammps文件夹中。

第三步：打开计算机的命令提示符，进入到F盘下的lammps文件夹中。输入运行命令：lmp_serial<in.crack回车命令开始运行。结果如图一所示。

第四步：命令运行完毕后，在lammps文件夹下面会多出两个文件log.lammps和dump.colloid；第一个是命令提示符窗口运行的日志文件，第二个是输出结果文件，用OVITO可视化软件可以打开。

（2） 多核并行运算

第一步：将MPICH2文件夹中bin文件里面的mpiexec.exe和smpd.exe复制出来放到F盘下要跑程序的文件夹中。

第二步：将要运行的in文件也复制出来放到要跑程序的文件夹中。

第三步：以管理员身份运行cmd，键入mpiexec -np 4 -localonly lmp_mpi.exe < in.文件，其中4表示核数。结果如图二所示。