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关于METTL4

已有 2524 次阅读 2020-3-23 12:05 |系统分类:科研笔记

最近看到两篇METTL4的文章挺有意思的,都发在很不错的期刊上,但是结论却是不大相同。

# 第一篇文章:

Cell Research 2020年1月8日online一篇哈佛医学院Yang Shi等人的Letter。主要结论是:METTL4 is an snRNA m6Am methyltransferase that regulates RNA splicing。也即:METTL4是核内的m6Am甲基转移酶

结论1:

METTL4有明显的核定位信号,染色显示外源METTL4主要定位于核

结论2:

293T敲了METTL4第4个exon,total RNA的m6Am降低。相比较下,gDNA和mtDNA的6mA没有改变,同时检测不到线粒体中的m6Am(非常微量,作者解释为contaminate)。

结论3:

影响可变剪切:637 up-regulated vs 765 down-regulated

结论4:

Work的motif: AAG

# 第二篇文章:

Molecular Cell 2020年3月9日online一篇何川老师的文章:N6-Deoxyadenosine Methylation in Mammalian Mitochondrial DNA。 主要结论是:METTLE4是哺乳动物线粒体中的6mA的甲基转移酶

结论1:

使用IMPI预测METTL4有很好的线粒体定位信号score。染色显示,METTLE4和线粒体和m6A在HepG2和HeLa cells共定位

结论2:

METTL4 knock down后线粒体6mA水平降低。线粒体的rRNAs,mRNAs, small RNAs的m6A和m6Am水平没变。

结论3:

可变剪切影响很小。

结论4:

work motif:  CTMATC

作者在Discussion中也提到了前者的文章:

A recent study reported that METTL4 acts as a methyltransferase to install internal m6Am methylation on U2 small nuclear RNA (snRNA) in HEK293T cells, suggesting that METTL4 could play a nuclear role in RNA splicing regulation (Chen et al., 2020). A majority of METTL4 protein localize in mitochondria in cells studied in this work...

The role of METTL4 seems to be context dependent. It affects mitochondrial activity when it localizes to mitochondria; when it resides mostly in nucleus, it may affect splicing.

两相比较何川老师组的数据更多,更显全面。有意思的是,两篇文章都没有公布测序的原始data。相信后面很快还会有M4的文章出来。

阅读原文




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