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- 置顶 · 用AutoDock进行分子对接教程——半柔性对接
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- Linux中快速创建大量文件夹的命令
- 以下所有内容均属于个人学习过程中的总结，如有错误，欢迎批评指正！ Linux下快速创建大量文件夹的命令 First release：2018-08-07 Last update: 2018-08-014 在linux使用过程中有时会需要创建大量的文件夹，创建文件夹的命令是mkdir 内容如下，直接在shell ...
- AMBER中mdout_analyzer.py和ambpdb的使用
- 以下所有内容均属于个人学习过程中的总结，如有错误，欢迎批评指正！ AMBER中 mdout_analyzer.py 和 ambpdb 的使用 First release：2018-07-22 Last update: 2018-07-22 本文内容基于Amber最新版本Amber18 mdout_analyzer.py 是快速分析sander和pmemd计算得到的out文 ...
- Amber和Gaussian联用计算RESP原子电荷
- 以下所有内容均属于个人学习过程中的总结，如有错误，欢迎批评指正！ Amber和Gaussian联用计算RESP原子电荷 First release：2018-03-17 Last update: 2018-07-22 原子电荷 ，顾名思义就是位于原子中心点的电荷，是对体系中电荷分布最为简单的描述。原子电荷可以帮助化学研究者们考察 ...
- 用Amber进行能量分解和计算结合自由能——MMPBSA工具
- 以下所有内容均属于个人学习过程中的总结，如有错误，欢迎批评指正！ 用Amber进行能量分解和 计算 结合自由能 First release：2018-01-13 Last update: 2018-03-17 Amber是一款适用于生物大分子的动力学模拟的软件，其官方网站是 http://ambermd.org/index.html ，目前最新版本为Amber17 ...
