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你的miRNA-seq数据要重新分析吗?
王程扬 2018-3-22 16:01
本文转载自嘉因微信公众号,已获得授权。查看最新文章,敬请关注嘉因,微信ID:rainbow-genome 作者:小丫 来源: 嘉因 看过《 我研究的miRNA没,没,没了 》的小伙伴儿心里发慌: miRBase 22跟21相比,删掉了52个人类miRNA,新增了156个,13个改名了,21个序列还变了。那我的miRNA-seq数据岂 ...
个人分类: RNA-seq|3172 次阅读|没有评论
我研究的miRNA没,没,没了
王程扬 2018-3-22 15:51
本文转载自嘉因微信公众号,已获得授权。查看最新文章,敬请关注嘉因,微信ID:rainbow-genome 作者:小丫 来源: 嘉因 希望标题的情况不要发生在小伙伴儿身上。。。不过,miRNA的名字、序列可能变了,heatmap可能要重新画了,投稿时你好意思用v21版本吗?! 话说沉寂了3年多的miRBase, ...
个人分类: RNA-seq|2043 次阅读|没有评论
以生物学家的方式纪念霍金
王程扬 2018-3-15 10:53
本文转载自嘉因微信公众号,已获得授权。查看最新文章,敬请关注嘉因,微信ID:rainbow-genome 作者:小丫 来源: 嘉因 物理学家史蒂芬·霍金去世,享年76岁 � � 21岁时,霍金患上肌肉萎缩性侧索硬化症(卢伽雷氏症,ALS) 2014年,霍金参加冰桶挑战; ...
个人分类: 表观遗传|1890 次阅读|没有评论
用别人的数据发自己的Science | 给你的文章加5分
王程扬 2018-3-7 09:55
本文转载自嘉因微信公众号,已获得授权。查看最新文章,敬请关注嘉因,微信ID:rainbow-genome 作者:小丫来源: 嘉因 文中有【彩蛋】脑补2016年一篇Science paper作者的心路历程: MYC regulates the antitumor immune response through CD47 and PD-L1, Science , ...
个人分类: 生物paper|2859 次阅读|没有评论
哪个转录因子调控你的基因?Plan C,不需要那么多ChIP-seq
热度 1 王程扬 2018-2-23 10:49
本文转载自嘉因微信公众号,已获得授权。查看最新文章,敬请关注嘉因,微信ID:rainbow-genome 作者:小丫 来源: 嘉因 《 哪个蛋白质调控我感兴趣的基因? 》一文讲了找上游转录因子的三种策略: Plan A: 基于大量ChIP-seq公共数据挖掘 Plan B: motif分析预测 Plan C:DNase ...
个人分类: 转录调控|7918 次阅读|1 个评论 热度 1
国自然有这个图,谁敢说缺创新点
热度 1 王程扬 2018-2-23 10:45
本文转载自嘉因微信公众号,已获得授权。查看最新文章,敬请关注嘉因,微信ID:rainbow-genome 作者:小丫 来源: 嘉因 出自http://ipp.jaas.ac.cn/Article/UploadFiles/201109/2011092817254731.ppt 新理论(新方法)研究新/老问题,小丫擅长,至少四颗星。 找哪 ...
个人分类: 自然NIH|3709 次阅读|1 个评论 热度 1
任意两组RNA-seq变身,国自然得AAA
王程扬 2018-2-23 10:43
本文转载自嘉因微信公众号,已获得授权。查看最新文章,敬请关注嘉因,微信ID:rainbow-genome 作者:小丫 来源: 嘉因 《 RNA-seq这样画图,国自然必得A 》介绍的4个图,需要满足两个条件,才能让RNA-seq结果迅速变成高富帅。本期介绍的方法适用于 任意两组RNA-seq : 这两组sample可以是 ...
个人分类: 自然NIH|3188 次阅读|没有评论
国自然爱明星,拉你的基因进明星通路,一图搞定
王程扬 2018-2-23 10:29
本文转载自嘉因微信公众号,已获得授权。查看最新文章,敬请关注嘉因,微信ID:rainbow-genome 作者:小丫 来源: 嘉因 明星人人爱,我家小汪也想跟明星攀亲戚。 这里有个 神图 看到明星通路中的小紫结合在小汪转录起始位点附近,推测小汪被小紫调控,从而参 ...
个人分类: 转录调控|3038 次阅读|没有评论
RNA-seq这样画图,国自然必得A
王程扬 2018-2-9 14:50
本文转载自嘉因微信公众号,已获得授权。查看最新文章,敬请关注嘉因,微信ID:rainbow-genome 作者:小丫 来源: 嘉因 RNA-seq结果只知道画heatmap、富集分析、pathway、network? 本文介绍的这几个图,通过整合RNA-seq、已发表的ChIP-seq数据,让你的 RNA-seq图迅速变身高富帅 。 适用范围 RN ...
个人分类: RNA-seq|14642 次阅读|没有评论

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