ChengyangWang的个人博客分享 http://blog.sciencenet.cn/u/ChengyangWang

博文

按标题搜索
ChIPseq数据分析基础 + ENCODE pipeline Q & A视频
2017-12-19 10:07
本文转载自嘉因微信公众号,已获得授权。查看最新文章,敬请关注嘉因,微信ID:rainbow-genome 作者:小哈 来源: 嘉因 德国海德堡大学ChIP-seq数据分析基础课程视频 用公共数据,就一定会用到ENCODE的ChIP-seq数据,ENCODE怎么处理来自众多实验室的结果?怎样消除batch effect?怎样处理重复? ...
个人分类: Chip-seq|3792 次阅读|没有评论
ChIP-seq基础知识视频集锦 | MIT公开课
2017-12-19 10:06
本文转载自嘉因微信公众号,已获得授权。查看最新文章,敬请关注嘉因,微信ID:rainbow-genome 作者:小丫 来源: 嘉因 MIT公开课ChIP-seq课程视频,ppt+黑板讲解,推荐 ChIP-seq基础知识和分析原理,白板讲解,精炼 能听懂下面这段,说明你的ChIP基本原理已经炉火纯青 同期推 ...
个人分类: Chip-seq|2256 次阅读|没有评论
找转录因子靶基因,没有ChIP抗体?ATAC-seq也能实现
2017-12-19 09:55
本文转载自嘉因微信公众号,已获得授权。查看最新文章,敬请关注嘉因,微信ID:rainbow-genome 作者:小丫 来源: 嘉因 小伙伴儿都知道 嘉因生物擅长做ChIP-seq ,好多公司也把ChIP实验外包给嘉因生物。 ChIP实验,这家公司做的怎么样?有图有真相 。 ChIP-seq 是 转录调控 研究 神技 ATAC-seq ...
个人分类: ATAC-seq|5395 次阅读|没有评论
表观遗传是怎样遗传的?
热度 1 2017-12-18 16:24
本文转载自嘉因微信公众号,已获得授权。查看最新文章,敬请关注嘉因,微信ID:rainbow-genome 作者:小丫 来源: 嘉因 没法参加今天的 表观遗传调控盛宴·细胞生物学学会2017年会 ,等不及看小伙伴儿分享的参会感受,怎么办?先来看清华大学颉伟研究员去年8月在表观基因组学暑期国际讲习班的课程 ...
个人分类: 表观遗传|21207 次阅读|2 个评论 热度 1
最靠谱的富集分析,超炫的展示方式,TCGA也是他的粉丝
热度 1 2017-12-18 15:57
本文转载自嘉因微信公众号,已获得授权。查看最新文章,敬请关注嘉因,微信ID:rainbow-genome 作者:小哈 来源: 嘉因 文末有福利! 小伙伴儿看题目就猜到了 没错,小哈也是那个拽的不要不要的Y叔的粉丝。 上次发帖说 不懂生信,不装Linux,也能Run代码—Windows系统的Linux命令行 ...
个人分类: Chip-seq、ATAC-seq实验分析|8855 次阅读|1 个评论 热度 1
ChIP-seq和RNA-seq整合分析,BETA最擅长
2017-12-18 15:36
本文转载自嘉因微信公众号,已获得授权。查看最新文章,敬请关注嘉因,微信ID:rainbow-genome 作者:小哈 来源: 嘉因 如 何 用自己的双手,分析自己的数据? 文末有 完美 解决方案 用BETA能get到哪些生物学特征? 预测转录因子的功能是激活还是抑制; 识别转录因子的 ...
个人分类: Chip-seq、ATAC-seq实验分析|11642 次阅读|没有评论
miRNA家族成员列表下载 | 人/小鼠/果蝇/线虫 | 还提供命令行
2017-12-18 15:20
本文转载自嘉因微信公众号,已获得授权。查看最新文章,敬请关注嘉因,微信ID:rainbow-genome 作者:小哈 来源: 嘉因 同一miRNA家族的miRNA拥有共同的种子seed序列,分享共同的靶基因(不完全相同),因此,研究miRNA与protein-coding gene、lncRNA、circle RNA的调控关系时,都要check一下同一 ...
个人分类: RNA-seq|6506 次阅读|没有评论
miRNA的RT-qPCR验证,小伙伴儿亲测,高效,便宜,不限物种
2017-12-18 15:08
本文转载自嘉因微信公众号,已获得授权。查看最新文章,敬请关注嘉因,微信ID:rainbow-genome 作者:小丫 来源: 嘉因 去年6月,小丫写了 这篇帖子 ,吸引了好多小伙伴儿用这套方法做验证,有了困惑通过销售转告给小丫,小丫解答的很开心~ ~ ~ 现在重新整理一下帖子,力求描述的更清晰,希望能更方 ...
个人分类: RNA-seq|12631 次阅读|没有评论
全世界的miRNA分析工具都在这里
2017-12-18 15:00
本文转载自嘉因微信公众号,已获得授权。查看最新文章,敬请关注嘉因,微信ID:rainbow-genome 作者:小丫 来源: 嘉因 如果评选年度最佳生物信息网站,我就选tools4miRs ! 来自伟大的波兰,居里夫人的祖国!纪念居里夫人诞辰150周年。 延伸阅读: 居里夫人诞辰150周年 | 重温饶 ...
个人分类: RNA-seq|5830 次阅读|没有评论
选哪个lncRNA的哪段设计引物?RT-qPCR验证,我要百发百中!
热度 1 2017-12-18 13:40
本文转载自嘉因微信公众号,已获得授权。查看最新文章,敬请关注嘉因,微信ID:rainbow-genome 作者:小丫 来源: 嘉因 前几年是lncRNA测序时代,最近进入了 后lncRNA时代 ,人们都在研究lncRNA的功能和调控机制。 去年4月,小丫写了 这篇帖子 ,得到的评价是“看透了lncRNA验证,但描述得不够清楚 ...
个人分类: RNA-seq|20424 次阅读|1 个评论 热度 1

Archiver|手机版|科学网 ( 京ICP备07017567号-12 )

GMT+8, 2024-4-20 01:41

Powered by ScienceNet.cn

Copyright © 2007- 中国科学报社

返回顶部