任意两组RNA-seq变身，国自然得AAA

王程扬 2018-2-23 10:43

本文转载自嘉因微信公众号，已获得授权。查看最新文章，敬请关注嘉因，微信ID：rainbow-genome 作者：小丫 来源： 嘉因 《 RNA-seq这样画图，国自然必得A 》介绍的4个图，需要满足两个条件，才能让RNA-seq结果迅速变成高富帅。本期介绍的方法适用于 任意两组RNA-seq ： 这两组sample可以是 ...

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国自然爱明星，拉你的基因进明星通路，一图搞定

王程扬 2018-2-23 10:29

本文转载自嘉因微信公众号，已获得授权。查看最新文章，敬请关注嘉因，微信ID：rainbow-genome 作者：小丫 来源： 嘉因 明星人人爱，我家小汪也想跟明星攀亲戚。 这里有个 神图 看到明星通路中的小紫结合在小汪转录起始位点附近，推测小汪被小紫调控，从而参 ...

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RNA-seq这样画图，国自然必得A

王程扬 2018-2-9 14:50

本文转载自嘉因微信公众号，已获得授权。查看最新文章，敬请关注嘉因，微信ID：rainbow-genome 作者：小丫 来源： 嘉因 RNA-seq结果只知道画heatmap、富集分析、pathway、network？ 本文介绍的这几个图，通过整合RNA-seq、已发表的ChIP-seq数据，让你的 RNA-seq图迅速变身高富帅 。 适用范围 RN ...

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他中了国自然，因为最后一周补了这张图

热度 1 王程扬 2018-2-8 15:13

本文转载自嘉因微信公众号，已获得授权。查看最新文章，敬请关注嘉因，微信ID：rainbow-genome 作者：小丫 来源： 嘉因 国自然倒计时1个月，想挖机制，还想加个图，体现工作量，显得基础扎实，怎么办？ 比如说基因已经做了功能研究，需要挖机制，完善故事；再比如说lncRNA KO/KD已经看出表型，可是 ...

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Plan A详细步骤1234 | 哪个转录因子调控我的基因？

王程扬 2018-2-8 11:03

本文转载自嘉因微信公众号，已获得授权。查看最新文章，敬请关注嘉因，微信ID：rainbow-genome 作者：小丫 来源： 嘉因 《 哪个蛋白质调控我感兴趣的基因？怎样筛选？基于分析或实验的可行方案V2.1 》一文讲了找上游转录因子的策略： Plan A：基于大量ChIP-seq公共数据挖掘 Plan B：motif分析 ...

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史上最全物种转录因子、motif数据库footprintDB

热度 1 王程扬 2018-1-25 17:39

本文转载自嘉因微信公众号，已获得授权。查看最新文章，敬请关注嘉因，微信ID：rainbow-genome 作者：小丫 来源： 嘉因 《 点鼠标就能找启动子区的motif》， 给出了7种 从一段DNA上找某个motif 的方法。前提是找到这个转录因子的motif文件，如果在 JASPAR里查不到，就去 footprintDB试试 ...

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