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123R简介和统计绘图
2020-8-31 22:26
123R简介和统计绘图 本节作者:刘永鑫 中国科学院遗传与发育生物学研究所;陈同 中国中医科学院 版本1.0.2,更新日期:2020年8月31日 本项目永久地址: https://github.com/YongxinLiu/MicrobiomeStatPlot ,本节目录 123R,包含R markdown(*.Rmd)、Word(*.docx)文档、测试数据和结果图表,欢迎广大同行帮忙审核校 ...
个人分类: 微生物组专著|2869 次阅读|没有评论
122Linux系统和Shell命令行简介,走上数据分析之路
2020-8-31 20:44
122Linux系统和Shell命令行简介,走上数据分析之路 本节作者:刘永鑫 中国科学院遗传与发育生物学研究所 版本1.0.2,更新日期:2020年8月31日 本项目永久地址: https://github.com/YongxinLiu/MicrobiomeStatPlot ,本节目录 122Linux,包含R markdown(*.Rmd)、Word(*.docx)文档、测试数据和结果图表,欢迎广大同 ...
个人分类: 微生物组专著|3926 次阅读|没有评论
121个人电脑搭建微生物组分析平台(Win/Mac)
2020-8-28 23:16
121个人电脑搭建微生物组分析平台(Win/Mac) 本节作者:刘永鑫 中国科学院遗传与发育生物学研究所 版本1.0.3,更新日期:2020年8月27日 本项目永久地址: https://github.com/YongxinLiu/MicrobiomeStatPlot ,本节目录 121WinMacSoft,包含R markdown(*.Rmd)、Word(*.docx)文档、测试数据和结果图表,欢迎广 ...
个人分类: 微生物组专著|3423 次阅读|没有评论
252体现组间差异OTU模块的微生物网络图
热度 1 2020-8-20 21:35
252体现组间差异OTU/模块的微生物网络图 本节作者:李雨泽 西北农林科技大学 版本1.0.2,更新日期:2020年8月20日 本项目永久地址: https://github.com/YongxinLiu/MicrobiomeStatPlot ,本节目录 252NetworkModule,包含R markdown(*.Rmd)、Word(*.docx)文档、测试数据和结果图表,欢迎广大同行帮忙审核校对、并 ...
个人分类: 微生物组专著|8423 次阅读|1 个评论 热度 1
245热图展示微生物组的物种和功能丰度或有无
2020-8-13 21:43
245热图展示微生物组的物种和功能丰度或有无 本节作者:吴一磊 中科院微生物所 版本1.0.7,更新日期:2020年8月13日 本项目永久地址: https://github.com/YongxinLiu/MicrobiomeStatPlot ,本节目录 245Heatmap,包含R markdown(*.Rmd)、Word(*.docx)文档、测试数据和结果图表,欢迎广大同行帮忙审核校对、并提修 ...
个人分类: 微生物组专著|12307 次阅读|没有评论
CMJ:人类微生物组研究设计、样本采集和生物信息分析指南
2020-7-14 22:15
人类微生物组研究设计、样本采集和生物信息分析指南 A guide to human microbiome research: study design, sample collection, and bioinformatics analysis Chinese Medical Journal DOI: https://doi.org/10.1097/CM9.0000000000000871 Review: 2020-6-26 钱旭波 1 , 陈同 2 , 徐益萍 1 , 陈雷 3 , 孙馥 ...
个人分类: 微生物组专著|6691 次阅读|没有评论
246.三元图在微生物组研究中的应用与绘图实战
2020-6-29 00:04
三元图在微生物组研究中的应用 本节作者:吴一磊,中科院微生物所 版本1.0.5,更新日期:2020年6月28日 本项目永久地址: https://github.com/YongxinLiu/MicrobiomeStatPlot ,本节目录 246TernaryPlot,包含R markdown(*.Rmd)、Word(*.docx)文档、测试数据和结果图表,欢迎广大同行帮忙审核校对、并提修改意见。 ...
个人分类: 微生物组专著|11927 次阅读|没有评论
221.Beta多样性PCoA和NMDS排序
2020-6-27 23:04
Beta多样性与PCoA和NMDS排序 本节作者:文涛,刘永鑫 版本1.0.4,更新日期:2020年6月27日 本项目永久地址: https://github.com/YongxinLiu/MicrobiomeStatPlot ,本节目录 221BetaPCoA,包含R markdown(*.Rmd)、Word(*.docx)文档、测试数据和结果图表,欢迎广大同行帮忙审核校对、并提修改意见。提交反馈的三种方 ...
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