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[转载]Identity, Positive, 和Similarity的区别

2019-1-24 09:50

http://oldspace.biovip.com/500/spacelist-blog-itemtypeid-650.html identity和similarity有什么区别，发现自己对这几个概念也不甚了了，于是做了点功课，如下。 第一反应 去查了 BLAST的glossary Identity The extent to which two (nucleotide or amino acid) sequences are invariant. Similarity The extent ...

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[转载]计算生物学/生物信息学的未来是什么？

2019-1-24 09:48

1 基因的结构和功能确定。给定一条序列，如果能够找到与其相似度高的同源序列，那么它的结构和功能就差不多可以确定了。这个过程涉及到多序列比对和相似性搜 索。如果没法找到与之相似度高的序列，则需要考虑复杂一点的搜索技术，如基于profile的搜索和比对，或者寻找与之部分结构如结构域/motif相似 的序 ...

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已发表的文章

2018-10-26 10:04

已发表的小文章，欢迎大家引用，批评，指正！ 2017: Xueqin Wang, Xiaying Ye, Lei Zhao , Dezhu Li § , Zhenhua Guo § , Huifu Zhuang (2017), Genome-wide RAD sequencing data provide unprecedented resolution of the phy ...

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BAMM-Bayesian Analysis of Macroevolutionary Mixtures安装

2018-10-26 09:59

BAMM (Bayesian Analysis of Macroevolutionary Mixtures) is a program for modeling complex dynamics of speciation, extinction, and trait evolution on phylogenetic trees. 这个软件是分析多样性的，可以再苹果机，WINDOS, LINUX系统下使用。 http://bamm-project.org/index.html LINUX下面安 ...

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云之南的BLOG搬家到此

2018-10-26 09:51

由于163的BLOG：http://fhqdddddd.blog.163.com，已无法使用。因此，打算把上面的全部博文搬到这来。

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蔷薇类系统发育基因组学研究中取得新认识

2016-7-8 12:51

蔷薇类（rosids）和菊类（asterids）是真双子叶植物的两个主干分支，其中蔷薇类包括17个目，140个科，约70,000个物种，呈现了丰富的形态多样性，并具有重要的经济价值。近十几年以来，对叶绿体基因序列的分析支持蔷薇类分为豆类分支和锦葵类分支。其中，豆类分支包括固氮支系（由葫芦目Cucurbitales、壳斗目Fagales、豆目F ...

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Rosids_Phylogenomics

2016-7-1 12:12

文章在线了。 http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1055790316301452 全文及数据可以researchgate下载： https://www.researchgate.net/profile/Lei_Zhao15 http://arxiv.org/abs/1606.09348 Phylogenomic Analyses of Large-scale NuclearGenes Provide New Insights into the Evolutionary Relation ...

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