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2024年(1):利用深度学习方法生成大规模类药/类天然产物库—环结构识别新方法发展与应用
徐志建 2024-4-10 20:28
环状化合物在药物研发中占据极其重要地位。在 2021 年销售额排名前 200 的药品中,有 113 种药物为小分子药物,而其中有 112 种小分 ...
个人分类: 数据平台开发|279 次阅读|没有评论
[转载]2023年(3):An updated ETCM v2.0 database for TCM research
徐志建 2023-12-26 21:03
有关中医药的自主知识产权开源数据库——中医药百科全书(ETCM)已于2018年底上线,截至目前, 该数据库已 被 198 个国家或地区访问,总访问量为 56 万次 。 该数据库的研究论文已于2019年在国际著名期刊《核酸研究》(《Nucleic Acids Research》)发表,至今已被他引279次,并 入选“ ESI 高被引 ...
个人分类: 数据平台开发|493 次阅读|没有评论
2023年(2):基于多构象对接、配体相似性搜索和深度学习的综合性靶标预测与虚拟筛选平台D3CARP
徐志建 2023-12-26 20:30
药物与靶标相互作用( Drug-target interactions , DTIs )的识别是创新药物发现的关键一环,也是分子结构优化、药物重定位、药理机制探索以及药物潜在副作用早期预警等相关研究的重要基础。近年来,人工智能药物设计( Artificial Intelligence for Drug Discovery , AIDD )已成为备受关注的药物研究策略之一 ...
个人分类: 数据平台开发|819 次阅读|没有评论
2021年(2): D3DistalMutation——远端突变显著影响酶的活性
徐志建 2021-6-30 12:57
酶是一种非常重要的生物催化剂。在生物体中,酶能够加速化学反应并参与几乎所有的新陈代谢过程;在工业上,酶在催化抗生素合成和降解污染物方面发挥着不可或缺的作用。人们知道,酶的氨基酸突变可以影响其生物活性。这可以理解为,活性位点中的氨基酸或那些在空间上接近活性位点的氨基酸如果发生突变,将直接或间接影响酶 ...
个人分类: 数据平台开发|2997 次阅读|没有评论

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