赖江山的博客分享 http://blog.sciencenet.cn/u/laijiangshan 生态、统计与R语言

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IP: 1.202.186.*   [11]李晓亮   2012-4-16 16:15
赖老师,我想比较两个群落之间的相似关系,用什么方法比较好啊
IP: 210.72.80.*   [10]杨淇越   2012-2-10 18:34
谢谢赖老师,您的博客内容帮了我大忙了,衷心的感谢您!
IP: 218.6.135.*   [9]echo8914667   2012-1-2 16:49
赖老师您好:
  植物多样性和环境因子的关系,植物多样性的数据包括4个指标:植物物种数还有三个多样性指数,我想问下您,组织物种数据的时候,是该每个指标都和环境因子做个CCA图么??如果四个指标同时和环境因子进行CCA分析,能得出来环境因子对哪个指标影响比较显著么?刚接触软件,比较弱智的问题。
IP: 210.72.156.*   [8]张迎秋   2011-12-28 15:52
赖老师,您好!
在wintwins和PCORD中做twinspan分析时,都要设置cut level,个我有些细节不是特别懂,望您予以解答。我的数据前70%都是0,在80个百分点时是0.01,90个百分点时是0.04,最大值是1.06,这样的话,我该选择几个cut level,该分别选择什么,如何进行赋以权重?
IP: 218.94.142.*   [7]yezi0220   2011-10-18 21:54
赖老师您好,请问植物所近期有没有关于Canoco软件和R语言的培训?谢谢
IP: 58.246.138.*   [6]SWCZB   2011-10-15 10:50
赖老师:
   您好!
   我分析环境因子对细菌群落结构组成的影响,分别采集10个点的样品,测定10个点中样品的环境参数和细菌数量,按照你在CANOCO教程中的操作进行使用(我第一次学习使用该软件,以前统计软件不会用,都是请教其它同学,由于这个软件他们也没有使用过,又没有时间来慢慢学习使用,只有自己学习使用)。我是把每个点的细菌数量作为第一列,溶氧、总氮等分别作为第二列、第三列等,但结果显示出来不是的。并且应用canoco软件进行排序后(CCA)分析后,不知哪个数据是种类与环境的相关系数以及环境与排序轴的相关性?
   非常期待您能在百忙之中为我答疑解惑,如在你方便是告知电话,我想给你打个电话能直接聆听你的指导,非常谢谢,我的电话是13072355848, bailu20059@126.com。
IP: 119.5.231.*   [5]echo8914667   2011-6-29 17:25
赖老师您好:
   我的数据比较多,是1-10年的人工林,测定一系列的指标,一共6个指标,并且和对照样地进行对比,随年龄的变化我用的就是回归分析,各个指标分别回归,和对照样地的对比,我用的是多重比较,既每个年龄的每个指标都和对照样地进行对比,多重比较的结果非常冗长。
投稿,审稿人说,
The multiple comparisions test is not appropriate to data (too much comparisons, and combinations without testing interactions). I think multivariate analysis (AFC, CCA, db-RDA) on total density and diversity of the measured indices could highlight some combinations, which, then could be tested bu Tuckey's test.

我没做过这些分析,不晓得是啥意思,是不是看我这些指标到底哪些变化比较大,然后就针对这个变化明显的和对照进行对比呢?
我的回复(2011-6-30 15:39):让你用排序方法分析,找出规律后,再进行局部的多重比较(Tuckey test)
IP: 58.213.137.*   [4]李修强   2011-4-16 20:21
赖老师,您好。我现在在学习用CANOCO软件做RDA,PRC等多元统计。但遇到了一个问题,我一直不知怎么去解决,特向赖老师请教。我 想探究土壤线虫群落组成与土壤环境因子之间的关系,想用RDA分析,但我的数据是五次采样的结果,我就不知道环境因子的数据如何正确排列,恳请赖老师指点,晚辈不胜感激。
我的回复(2011-6-30 15:50):每年的数据都可以当作一个因子
关于多次测量的数据,这本书的第215页 case study 15 讲了全部过程,请参考!
http://www.planta.cn/forum/files_planta/multivariate_analysis_of_ecological_data_using_canoco_592.pdf
IP: 61.180.240.*   [3]王建国   2011-3-26 09:35
   赖老师很辛苦啊,这么多人向您请教!致敬
我的回复(2011-6-30 15:50):谢谢!
IP: 220.161.251.*   [2]林巧香   2011-1-27 22:53
赖老师:
   您好!
   非常有幸能在生物多样性年会上聆听您宝贵的演讲,并获得您的宝贵意见,如获至宝,深深受益。但至今有一个问题深深困扰我:应用canoco软件进行排序后(CCA)得到的种类与环境的相关系数以及环境与排序轴的相关性,如何知道结果是否显著呢?比如:排序轴(axi1~4)种类与环境相关系数分别为:0.7、0.6、0.3、0.2,那么它们是否显著相关呢?
   非常期待您能在百忙之中为我答疑解惑,千言万语无法表达对您的感谢!祝您新春愉快!万事如意!
我的回复(2011-6-30 15:52):这个相关性类似两个变量的相关性,可以查相关系数表获得,自由度为样点的个数-1
IP: 58.240.39.*   [1]gqiner   2011-1-23 17:00
赖老师,您好!很感谢您给大家提供那么方便而有用的学习资源。我也是一个初学者,想请教您一个问题,就是我安装好canoco之后,canodraw不能用,老是提示canodraw for windows works only if at least one printer is installed,请问这是什么原因?该怎么解决呢?谢谢
我的回复(2011-6-30 15:54):删除,重新下载一个版本安装。

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