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[转载]架起生态统计学应用新“桥梁”
赖江山 2022-7-20 08:28
https://news.sciencenet.cn/htmlnews/2022/7/482963.shtm 随着生态学进入大数据时代,先进的数据分析技术和生态统计模型成为整合生态大数据、发现有价值的生态学规律的重要“桥梁”。 但生态学家经常会在模型使用过程中遇到各种统计学方法的问题。例如典范分析中共线性解释变量的相对重要性评估就是其中之一。 对此, ...
个人分类: rdacca.hp|893 次阅读|没有评论
rdacca.hp包第一次被外国人的研究(Diversity and Distribution)使用
赖江山 2022-6-17 08:19
rdacca.hp包第一次被外国人(挪威)的研究员人员使用,文章里面对HP在典范分析的英文描述值得大家借鉴,特别是这个unordered assessment of importance的作用很重要。 We used a hierarchical partitioning to estimate the importance o ...
个人分类: rdacca.hp|730 次阅读|没有评论
关于rdacca.hp和glmm.hp含有定量变量交互作用项的问题
赖江山 2022-5-27 22:38
rdacca.hp和glmm.hp包分别是用来做典范对应分析和广义混合效应模型的R2层次分割的包,可以获得每个预测变量(解释变量)的分配的R2, 目前函数并不支持含星号的交互作用项。但如果用户有时候确需要加上交互作用项,也想获得交互项解释的比例也可以,对于两个定量解释变量交互项其实就是这个两个变量的乘积,因此在原始数据 ...
个人分类: rdacca.hp|1139 次阅读|没有评论
关于rdacca.hp包如果做dbRDA的R2分解,总R2大于1,一定要在rdacca.hp函数里面参数add=T
热度 1 赖江山 2022-5-26 17:00
刚有个学生问: 我用rdacca.hp分析环境对beta多样性解释度时(dbRDA),得出来的总解释度为1.5多? 这样肯定不对,这是在做PcoA的过程产生负的特征根导致的。这种情况,可以在rdacca.hp函数里面设置add=T,即校正负的特征根即可。 刚才案例加上add=T,总R2立马变为0.71
个人分类: rdacca.hp|882 次阅读|2 个评论 热度 1
rdacca.hp讲座
热度 1 赖江山 2022-4-7 19:23
HD讲座.pdf the code for rdacca..hp paper.r
个人分类: rdacca.hp|1526 次阅读|2 个评论 热度 1
rdacca.hp的文章有正式的页码
热度 1 赖江山 2022-4-5 17:35
rdacca.hp包的文章终于有了正式的页码,MEE刚刚出炉的2022年第四期正式发表,从2022年1月12日在线发表到现在,已经被通知有了3次的正式引用,在bioRxiv上的preprint版本也不断被引用(目前已经达到14次),还有引用CRAN上面的包的也有40多次。相信正在撰写或是投稿中的引用还很多,建议大家以后都引用MEE正式发表的文章。 ...
个人分类: rdacca.hp|1309 次阅读|3 个评论 热度 1

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GMT+8, 2022-8-9 04:51

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