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动物育种中配合力的计算方法
邓飞 2018-6-30 18:52
第一篇: Adenaike A S, Osisanya T O, Ogunsola O D, et al. Combining Ability and Inheritance of Growth Traits in Rabbits . Journal of Biology Agriculture Healthcare, 2013. 三个兔子品种,进行双列杂交(无自交,有正反交),共6个组合,测量子代的性状,评价三个兔子品种的一般配合力和特殊配合力。 ...
个人分类: 数量遗传学|5288 次阅读|没有评论
Context 修改文件后自动保存 不提示保存
邓飞 2018-6-28 22:04
Context,运行asreml软特别方便 但是运行程序是,文件改变,提醒文件更改,挺繁琐,可以设置为自动保存,不用手动每一次点击: 设置方法: 点击Option,选择Environment Options 选择Automatically update changed files 点击OK 设置成功!
个人分类: 数量遗传学|1775 次阅读|没有评论
怎么快速学习GWAS?
邓飞 2018-5-11 19:38
https://www.researchgate.net/post/What_is_the_fastest_way_to_learn_how_to_perform_GWAS_Association_mapping_in_plants_using_GAPIT_an_R_package_What_are_the_available_resources2 What is the fastest way to learn how to perform GWAS (Association mapping) in plants, using GAPIT (an R package )? W ...
个人分类: 数量遗传学|4663 次阅读|没有评论
如何计算遗传相关(How to)
邓飞 2018-5-7 17:51
Q1 植物或林木育种中,我的数据类型包括基因型(品种),地点(环境),重复(或者无重复),还有一系列性状,比如株高、产量等等,我怎么计算性状间的遗传相关,并且给出显著性? 示例数据 数据描述:location为地点,Genotype为基因型,Rep为重复,DWKPlant, DWKEar, TW, KDM, ...
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如何根据系谱计算共祖系数和近交系数以及亲缘关系系数
邓飞 2018-4-9 08:48
《线性模型在动物育种值预测中的应用》 第二章:亲属间的遗传协方差,P19 概念定义 共祖系数: 共祖系数为概率fAB,表示一个来自个体A,另一个来自个体B的两个同源基因(或等位基因)在系谱上是一致或相同的概率,也就是说来自同一祖先基因的概率, 相关系数: 是2倍的共祖系数 近交系数: 近交系数(inbre ...
个人分类: 数量遗传学|11178 次阅读|没有评论
阈值性状与连续性状&阈值性状与阈值性状的遗传相关分析-asrmel4r
邓飞 2018-3-20 10:51
阈值性状与连续性状阈值性状与阈值性状的遗传相关分析-asrmel4r asreml3中,还不支持阈值性状与连续性状的相关分析,现在asreml4r中支持了,下面用实际的案例介绍一下实现方法 与两性状分析的模型基本一致,关键是指定两性状的分布:family=list(asr_binomial(),asr_gaussian()) library(asreml) Loadingrequ ...
个人分类: 数量遗传学|3975 次阅读|没有评论

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