如何用logistic回归曲线拟合日照和生物量积累的模型

邓飞 2017-12-22 17:18

数据 SPSS错误的做法 很遗憾，spss对于logistic默认的方法不是我们想要的！ 错误的做法步骤： 1，打开模型，回归-→ 曲线回归 —-→ logistic 2，查看结果 这里y变量变成了 ln(1/生物量)， 系数为：0.999，常量为：0.013，标准化的系数0.397. 很显然，怎么转换不能够和我们熟悉的logistic回归曲线联系 ...

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一年多点品种的回归系数和相关系数

邓飞 2017-12-11 20:09

数据 one-year-loc.xlsx GenStat结果：F-W回归分析 回归系数的计算方法 这里 y值是品种在三个地点的观测值 x值是地点所有品种的平均值 这里以dai15为例，解释一下计算方法，整理数据：Y值 X值： ...

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G矩阵的计算方法（R语言实现）

邓飞 2017-11-23 11:31

参考文献：http://articles.extension.org/pages/68019/genomic-relationships-and-gblup 生成模拟的基因型原始数据 snp - c(AA Ct GG Ag AA Ct Ga AA tt CC GG AA) ss - strsplit(snp,split = ) snpM - matrix(ss ],3,4,byrow = T) row.names(snpM) - c(ID1,ID2,ID3) ...

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Partially replicated (p-rep) designs 文献解析及实现方法

邓飞 2017-8-23 17:58

参考文献 Moehring J, Williams E R, Piepho H P. Efficiency of augmented p-rep designs in multi-environmental trials . Tag.theoretical Applied Genetics.theoretische Und Angewandte Genetik, 2014, 127(5):1049-1060. 摘要 这篇论文介绍了在多环境测试（MET）中效率较高的试验设计方案：部分重复设计（ ...

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关于MET数据中地点间异质性检验的问题

邓飞 2017-6-27 08:50

绍GenStat、ASReml和R语言处理的方法 介绍GenStat、ASReml和R语言处理的方法 数据：wang9.1.csv wang9.1.csv GenStat 处理方法 ANOVA 对数据进行筛选，选择第一个地点的数据，进行分析，得到第一个地点的MSE。 第一个地点的自由度和MSE 10个地点的DF和MSE： Bartlett’s test GenStat command： VHOMOGENEITY ...

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ASreml -r 及R语言 内存设置方法

邓飞 2017-6-19 15:02

​ workspace设置 8e6 = 64Mb 8e7 = 640Mb ​ 具体设置 设置 | 实际 —-|—- 8e6 | 64 Mb 1.28e8 | 1G 2.5e8 | 2Gb 5e8 | 4Gb 1e9 | 8 Gb 1.5e9 | 12Gb G矩阵占用内存的计算方法： 个体ID 标记数 8 /(1024*1024) = Mb 示例代码： asreml中设置运行内存为8G, ...

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田间鉴定试验设计三部曲

邓飞 2017-5-23 10:44

本次介绍田间试验设计中常用的试验设计方法以及实现途径，试验类型分为初级试验、中级试验和高级试验。 试验设计方法： 初级试验 假设一家育种单位，选育玉米品种，前期配了5000个组合，由于种子量比较少，只能种植两行区一次重复。 可选试验方案：间比法、增广试验设计（augmented design）、P-rep设计 中级试验 ...

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