科学网—QHDXZJW的博文

Materials Studio官方教程：Mesocite——磷脂双分子层的粗颗粒化分子动力学【1】

赵建伟 2022-3-16 12:48

目的：介绍利用介观建模工具建立和模拟磷脂双分子层的方法。所用模块： Materials Visualizer、Mesocite 背景与原子的分子动力学相比，粗粒化分子动力学能够模拟更长的时间尺度和更大的长度尺度。这是通过将多个原子组成的群表示为单个单元或珠子来实现的。力场被参数化，用于体系中每种类 ...

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Materials Studio官方教程：Kinetix——CO在Pt(1 1 1)表面氧化的多位点模拟【3】

赵建伟 2022-3-15 01:50

Materials Studio官方教程：Kinetix——CO在Pt(1 1 1)表面氧化的多位点模拟【1】 Materials Studio官方教程：Kinetix——CO在Pt(1 1 1)表面氧化的多位点模拟【2】 7 、运行模拟在运行模拟之前，需要一个新的构型文档。在上一个教程中生成的构型文档是不够的，因为与以前的每个晶格单元仅有一个位点相比 ...

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Materials Studio官方教程：Kinetix——CO在Pt(1 1 1)表面氧化的多位点模拟【2】

赵建伟 2022-2-28 10:34

Materials Studio官方教程：Kinetix——CO在Pt(1 1 1)表面氧化的多位点模拟【1】 4 、添加解吸过程与吸附过程一样，也将在本例中添加比上一教程中更多的解吸过程。CO 2 的生成解吸过程有两种可能，一种使用来自fcc穴位的氧，另一种使用来自hcp穴位的氧。同样，氧的解吸也有两个过程。解 ...

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Materials Studio官方教程：Kinetix——CO在Pt(1 1 1)表面氧化的多位点模拟【1】

赵建伟 2022-2-25 09:47

目的：介绍多位点晶格上运行Kinetix 模拟的方法。所用模块： Materials Visualizer 、Kinetix 背景使用Kinetix 模块，通过动力学蒙特卡罗（kMC）模拟建模的体系，可以用不同程度的复杂度来描述。 CO在Pt(1 1 1)表面氧化的简单模拟（Simple modeling of CO oxidation on a Pt( ...

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Materials Studio官方教程：Kinetix——蒙特卡洛方法模拟CO的氧化【3】

赵建伟 2022-2-22 10:37

Materials Studio官方教程：Kinetix——蒙特卡洛方法模拟CO的氧化【1】 Materials Studio官方教程：Kinetix——蒙特卡洛方法模拟CO的氧化【2】 6、添加更多反应过程尽管到目前为止，所定义的模拟过程已经具有吸附CO和O 2 以及脱附CO 2 的必要过程，但它并不能正确地表示反应中涉及的全部过程。特 ...

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Materials Studio官方教程：Kinetix——蒙特卡洛方法模拟CO的氧化【2】

赵建伟 2022-2-21 10:00

Materials Studio官方教程：Kinetix——蒙特卡洛方法模拟CO的氧化【1】 3、创建初始构型除了这些过程之外，还需要建立模拟的初始构型。构型是指吸附质分布在各个位点上的方式。每个位点的占用与否对于构型的完整规范是必要的。应从一个空表面开始，其中所有位点都是未被占据的。可以使用Configu ...

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Materials Studio官方教程：Kinetix——蒙特卡洛方法模拟CO的氧化【1】

赵建伟 2022-2-18 10:10

目的：介绍利用Kinetix模块进行简单动力学蒙特卡洛模拟的方法。所用模块： Materials Visualizer、Kinetix 背景 Kinetix模块中的动力学蒙特卡罗（kMC）模拟是一种研究表面动力学的方法。它的特点是原子尺度的空间分辨率和时间尺度可与实验室中的动力学实验相媲美。它可以模拟长时间尺度的系统（ ...

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Materials Studio官方教程：GULP——拟合力场

赵建伟 2022-2-17 11:03

目的：说明在GULP中使用力场拟合功能来获取新的势能参数或精修现有参数的方法。所用模块： Materials Visualizer、GULP 介绍 GULP中的当前库没有描述SnO 2 块体结构的参数。因此，为了能够对这种材料进行建模并计算其各种性质，必须推导新的力场参数。可利用GULP中的力场拟合任务获得这些数据 ...

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Materials Studio官方教程：GULP——计算金刚石的性质

赵建伟 2022-2-16 10:05

目的：介绍利用GULP模块计算离子材料和分子固体性质的方法。所用模块： Materials Visualizer、GULP 介绍通常，Materials Studio中的经典模拟方法主要用于模拟液体或软材料的凝聚态以及分子结构。GULP模块可以模拟离子材料和分子固体，而离子材料和分子固体曾经是计算昂贵的量子力学计算领域。GU ...

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Materials Studio官方教程：Forcite——计算金属的熔化温度【3】

赵建伟 2022-2-15 15:49

Materials Studio官方教程：Forcite——计算金属的熔化温度【1】 Materials Studio官方教程：Forcite——计算金属的熔化温度【2】 5、构建共存单位晶胞现在，将使用Amorphous Cell Packing填充任务来构建共存单位晶胞。将固体NPT计算的最终轨迹复制到根目录中，并在此目录下执行之后的操作。 ...

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