博文

perl提取序列信息写入Excel表

2011-8-30 21:22

perl一个强大的地方，就是有很多别人写好的模块，可以直接搬过来用，就好像提供了很多现在的工具，找到合适的工具就能解决相应的问题，这里用了一个很强大的专门操作Excel的模块Win32::OLE，可以方便的用perl读写Excel数据，用perl提取genebank格式的序列文件中mRNA信息，然后将筛选结果输出到Excel中， ...

个人分类: 程序设计|9227 次阅读|没有评论

perl批量提取genebank序列文件中编码区、CDS长度、氨基酸等信息

2011-8-29 21:39

我们知道在mRNA的genebank格式的序列文件中包括了非常多的信息，怎样在里面提取想要的信息呢，现在有一个sequence.gb文件，里面包括了二千条拟南芥mRNA的序列信息，现要提取每条mRNA的accession、mRNA长度、description、gene_name、Gene_id、locus_tag、CDS长度、CDS序列、protein_id、product、 ...

个人分类: 程序设计|18183 次阅读|没有评论

本页有 7 篇博文因作者的隐私设置或未通过审核而隐藏