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置顶 · 升级版|16srRNA微生物多样性测序报告解读
2021-4-1 17:29
微生物多样性测序(扩增子测序)是基于二代高通量测序对16S/18S/ITS等序列进行测序。可以同时检测样本中的优势物种、稀有物种及一些未知物种的检测,获得样本的微生物群落组成以及相对丰度。 相信关注我们的小伙伴对此并不陌生。 这次我们整合了大家平时会遇到的一些问题,在原有的基础上对报告进一步完善。 ...
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置顶 · [转载]多快好省的宏基因组研究技巧 — 资深专家分享
2020-4-27 13:34
谷禾健康 原创 近年的研究热点集中于环境和生物体相互作用的微生物群体,而大量复杂的微生物群体存在培养困难,构成复杂(包括细菌、古菌、真菌、原生生物、病毒甚至小型真核生物)。因此 如何用高通量精准的了解这些群体的构成,基因功能分布以及具体的表达活性和代谢状况 成为首要问题。 高通量测序技术 ...
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置顶 · [转载]微生物多样性测序结果如何看?
隐藏 2019-11-18 14:37
原文 如何读懂和利用你的微生物多样性测序结果? 谷禾健康 原创 做过16s测序的小伙伴们都知道 测完之后会拿到一份结果报告 但这并不代表可以开始写文章了 看似一大堆数据图表却不知如何下手 这是很多人头疼的地方 那么怎样给报告中的数据赋予灵魂 让它真正成为对你有帮助的分析呢? 今天我们来详细解 ...
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[转载]揭秘猫狗的微生物世界:肠道微生物群的意义和影响
牛耀芳 2023-6-16 15:52
​ “铲屎官”们都希望自己的宠物有一个 健康的身体 。但是猫狗都不会说话,平时我们只能从它们的 精神状态 来判断它们是否健康,但这并不准确。去 宠物医院 又不太方便,很多猫咪和狗狗还会 对抽血等检查有所抗拒 。 肠道微生物检测 在人类中的应用已经相对成熟,而猫咪和狗狗与人同为哺乳动物,身体结构 ...
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[转载]谷禾杂谈 | 人类微生物组研究:解析挑战与前景
牛耀芳 2023-6-15 10:47
​ 人类微生物组研究正在从 描述关联 发展到了解整个微生态对人类的影响。虽然存在挑战,但在应用数据驱动的 微生物组诊断和干预 方面正在取得进展,这可能会在未来十年内带来 精准医学的突破 。 本文我们来探讨关于微生物组的研究进展及其对人类健康的影响及应用。 01 对微生物组认识、理解的历程: ...
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[转载]肠道细菌阻碍阿卡波糖的降血糖作用
牛耀芳 2023-6-12 15:49
我们知道,口服抗糖尿病药是治疗糖尿病的有效方式之一。然而,患者对抗糖尿病药的 反应程度各不相同 ,例如,有些患者在长期使用 阿卡波糖 后会产生耐药性。 阿卡波糖通常在饭前口服。它 抑制 人α-葡萄糖苷酶达到降血糖作用,包括唾液和胰淀粉酶,从而 减缓 复杂碳水化合物的消化,并 降低 餐后血糖水平的升高。 ...
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[转载]肠道有害菌属——假单胞菌属(Pseudomonas),多变且适应性强
牛耀芳 2023-6-8 10:12
​ 假单胞菌属 ( P seudomonas )是 最多样化和普遍存在 的细菌属之一,其物种存在于沉积物、临床样本、植物(或植物根际)、患病动物、水、土壤、海洋、沙漠等,这反映在它们 多变的代谢能力和广泛的适应环境 的潜力上。 假单胞菌属是一类革兰氏阴性的 好氧或微需氧的细菌 ,属于 Proteobacter ...
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[转载]花青素-肠道微生物群-健康轴
牛耀芳 2023-6-7 20:56
​ 经常听到一些专家在介绍食品或保健品时说富含 花青素 ,那么究竟什么是花青素?对我们的 健康 又有何益处? 花青素是在植物组织中发现的 天然水溶性色素 ,水果、蔬菜、花卉中的 呈色物质 大部分与之有关,是 类黄酮 的一个亚类,迄今为止已鉴定出 700多种 结构不同的花青素。 花青素是一种重要的营养 ...
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[转载]肠道菌群检测在临床感染中的应用
牛耀芳 2023-6-5 15:22
​ 感染 是人类面临的健康威胁之一。各种病原体,如细菌、病毒、真菌、寄生虫等,存在于我们日常接触的环境、物品、食物等中。一些常见的感染病例包括 感冒、流感、腹泻、组织器官或血液感染 等,在全球范围内广泛传播。这些疾病的传播方式多样,可能通过空气、水源、接触和食物等途径传播。 感染的症状包括 ...
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[转载]肠道菌群、性激素与疾病:探索它们的交互作用
牛耀芳 2023-6-5 11:57
​ 我们的身体中有很多 不同的器官,组织,腺体 等会产生许多 信号分子 来精确控制和影响身体的反应和活动,这些信号分子 包括激素、神经递质、生长因子、细胞因子 等。它们可以 促进或抑制细胞 的生长和分化,调节细胞间的 相互作用和通讯 ,影响身体的 代谢和能量平衡 ,参与 免疫系统 的细胞和分子相互作 ...
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[转载]肠道健康从核心菌属开始:肠道菌群的关键
牛耀芳 2023-6-2 13:02
5月29日,是 世界肠道健康日 。肠道是人体最重要的消化系统之一,与人体健康紧密相关。而 肠道菌群 作为肠道重要组成部分,在肠道健康中发挥着重要的作用。 ​ 由于基因、环境、饮食、药物等因素的影响,每个人的肠道菌群都有所不同,因此我们常常说每个人的肠道菌群都是 独一无二 的。 然而在不同 ...
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[转载]肠道重要菌属——Dorea菌,减肥过敏要重视它?
牛耀芳 2023-5-23 18:10
​ 认识 Dorea菌 Dorea 菌属于 厚壁菌门毛螺菌科 , 广泛 存在于 人体肠道内 ,谷禾数据显示该菌在人群的检出率超 89% 。该菌最早也是从人体粪便中分离出来。 “ Dorea” 目前没有一个确定的译名, Dorea 是以法国微生物学家 Joel Doré 的名字命名,以 表彰他对肠道微生物学 的诸多贡献。 该菌是一 ...
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[转载]一种新的算法模型,填补微生物组纵向研究数据中的缺失值
牛耀芳 2023-5-22 16:23
微生物组的纵向研究 是一种长期跟踪 微生物组变化 的研究方法。在这类研究中,样本从同一人群或个人中多次采集,通过检测样本中 微生物群落丰度 的变化 (如不同菌群的比例和种类),来了解微生物组 随时间的变化 趋势和特征。 根据微生物组不同菌群的变化,可以发现一些与 健康或疾病相关 的特征,从而为 疾病 ...
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