科学网—niuneat的博文

置顶 · 升级版|16srRNA微生物多样性测序报告解读

2021-4-1 17:29

微生物多样性测序（扩增子测序）是基于二代高通量测序对16S/18S/ITS等序列进行测序。可以同时检测样本中的优势物种、稀有物种及一些未知物种的检测，获得样本的微生物群落组成以及相对丰度。相信关注我们的小伙伴对此并不陌生。这次我们整合了大家平时会遇到的一些问题，在原有的基础上对报告进一步完善。 ...

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置顶 · [转载]多快好省的宏基因组研究技巧 — 资深专家分享

2020-4-27 13:34

谷禾健康原创近年的研究热点集中于环境和生物体相互作用的微生物群体，而大量复杂的微生物群体存在培养困难，构成复杂（包括细菌、古菌、真菌、原生生物、病毒甚至小型真核生物）。因此如何用高通量精准的了解这些群体的构成，基因功能分布以及具体的表达活性和代谢状况成为首要问题。高通量测序技术 ...

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置顶 · [转载]微生物多样性测序结果如何看？

隐藏 2019-11-18 14:37

原文如何读懂和利用你的微生物多样性测序结果？谷禾健康原创做过16s测序的小伙伴们都知道测完之后会拿到一份结果报告但这并不代表可以开始写文章了看似一大堆数据图表却不知如何下手这是很多人头疼的地方那么怎样给报告中的数据赋予灵魂让它真正成为对你有帮助的分析呢？今天我们来详细解 ...

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[转载]支原体——隐形且最小的细菌病原体，还会诱发“肺外症状”

牛耀芳 2023-12-15 16:31

支原体：小而隐蔽支原体（Mycoplasmas）是一种特殊且独特的细菌，是地球上已知的最小的自由生活的生物体。由于其体积较小，早些时候被误解为病毒。它小到用普通显微镜无法定位。事实上，大约 4000 个支原体可以轻松容纳在红细胞内。支原体既作为膜表面寄生虫存在于细胞外，也存在于 ...

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[转载]气温如同过山车？探索气候变化对肠道微生物组的影响

牛耀芳 2023-12-12 20:44

今年的天气，如此的奇怪：短袖和羽绒服之间，只差了一个降温忽冷忽热，气温仿佛过山车... 11月初多地气温破纪录，冬天集体迟到... 早穿皮袄午穿纱，每天不知道穿啥... 再不冷都不好意思过圣诞了... 好在前几天，冷空气又开始冲业绩了！当我们以为无限接近冬天的时候，本周四温度又会飙升到20多 ...

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[转载]发酵食品全解析：定义、种类与科学证实的健康优势

牛耀芳 2023-12-7 09:42

发酵食品被定义为“通过受控微生物生长以及通过酶作用转化食品成分而生产的食品或饮料。许多食物历史上都经历过发酵，包括肉和鱼、乳制品、蔬菜、大豆、其他豆类、谷物和水果。发酵过程中存在多种变量，包括微生物、营养成分和环境条件，从而产生了数千种不同的发酵食品。历史上，食品发酵被用作一种保 ...

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[转载]肠道炎症与年龄和阿尔茨海默病病理学相关：一项人类队列研究

牛耀芳 2023-12-5 15:01

阿尔茨海默研究表明，慢性低水平的炎症（“炎症衰老”）可能是年龄相关疾病的一个介导因素，而肠道微生物通过破坏肠道屏障可能会促进炎症。虽然老化和阿尔茨海默病（AD）与肠道微生物群组成的改变有关，但是肠道炎症的具体作用尚不清楚。刚刚，美国威斯康星州阿尔茨海默病研究中 ...

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[转载]肠道核心菌属——芽孢杆菌属，益生与病原双标签

牛耀芳 2023-12-5 14:05

芽孢杆菌属（ Bacillus ）是革兰氏阳性、杆状、芽孢杆菌科细菌的一个属，属于厚壁菌门。芽孢杆菌属物种可以是专性需氧微生物 (依赖氧气)或兼性厌氧微生物 (具有需氧或厌氧的能力)。当使用或存在氧气时，它们的过氧化氢酶检测呈阳性。 ▸ 芽孢杆菌分布广泛芽孢杆菌在自然界中无处不 ...

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[转载]躲过了支原体却没逃过流感？肠道调节减少呼吸道反复感染

牛耀芳 2023-11-29 11:11

成人每年大约会患上两到三次普通感冒，儿童每年可能会患上多达八次。而今年尤为显著，各大医院的儿科还是爆满状态，甚至是一号难求。肺炎支原体感染还没彻底过去，紧接着流感和其他呼吸道病原体感染又跟来了，医院爆满某种程度上又增加了交叉感染的风险... “孩子又发烧了” ...

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[转载]消化性溃疡与胃肠道微生物群

牛耀芳 2023-11-24 13:40

据柳叶刀统计，消化性溃疡 (PUD)每年影响全球400万人，据估计普通人群终生患病率为 5−10% (Lanas A et al., 2017)。尽管消化性溃疡的全球患病率在过去几十年中有所下降，但其并发症的发生率却保持不变。消化性溃疡是指胃或十二指肠黏膜发生超过2-5毫米的破损。其发病机制主要涉及胃粘 ...

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[转载]微量营养素缺乏引发肠道微生物组改变及抗生素耐药的新启示

牛耀芳 2023-11-20 12:18

我们知道，微量营养素在人体健康中发挥着重要作用。然而，在全球范围内，约有 3.4亿儿童患有多种微量营养素缺乏症，并伴有高致病性负担和耐多药细菌导致的死亡风险。这些儿童经常用抗生素治疗营养不良相关疾病。可矛盾的是，由于潜在的微量营养素缺乏，他们的肠道微生物组可能已经为抗生素耐药性 ...

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[转载]宠物猫可能塑造人类肠道中的抗生素耐药性和益生菌

牛耀芳 2023-11-17 10:19

宠物猫——伴侣——耐药性宠物可以为人类的身心健康做出贡献，它们通常与主人生活得很亲密，有时甚至睡一张床。然而，宠物与其主人之间的密切接触所带来的潜在生物安全风险常常被忽视。狗和猫是很受欢迎的宠物，也是人畜共患感染的重要来源。研究表明，宠物狗和猫可携带多种人类相关病原体和多种多重 ...

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[转载]拟杆菌在肠道感染中的矛盾作用

牛耀芳 2023-11-16 10:54

拟杆菌门细菌是革兰氏阴性菌的代表，具有外膜、肽聚糖层和细胞质膜。它们无氧呼吸的主要副产物是乙酸、异戊酸和琥珀酸。是最耐氧的厌氧菌之一。参与人体结肠中许多重要的代谢活动包括碳水化合物的发酵、含氮物质的利用以及胆汁酸和其他类固醇的生物转化。大多数肠道细菌是糖酵解的，这意味 ...

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