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GTDB——一个基于基因组的微生物分类数据库

已有 1080 次阅读 2024-8-2 23:45 |个人分类:【数据库】|系统分类:科研笔记

GTDB(Genome Taxonomy Database)官网

https://gtdb.ecogenomic.org/

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GTDB(Genome Taxonomy Database)是一个专注于基因组分类学的数据库,旨在提供高质量的细菌、古细菌、叶绿体和线粒体的分类信息。通过使用全基因组信息,GTDB提供了多级别的分类,包括域、界、纲、目、科、属等级别。其系统发育分类系统使得研究人员能够深入了解生物的演化和功能。GTDB主要以细菌中普遍存在的120个单拷贝蛋白质(bac120)和古菌中53个(arc53,从R07-RS207开始)标记蛋白为基础,在对多分组类别消歧后,根据相对演化散度标准化和分级,得到基因组分类结果。



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