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在Hi-C实验中寻找DNA结构域(TADs)的一种新方法:CHDF
2016-1-24 08:42
染色体的主要化学成分是脱氧核糖核苷酸(DNA )和蛋白质。DNA 分子是一条很长的双螺旋纤丝,如人类一号染色体约有三亿个碱基,这么长的DNA 分子必须通过复杂的折叠和螺旋形成高级的三维结构,从而压缩在狭小的细胞核中。 过去二十年里,测序技术开始逐渐普及,但测序测的只是我们基因 ...
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看图讲故事:Cell最近文章,进一步阐明基因组三维结构
2016-1-23 12:03
阮老师最近在 Cell 上发表新文“ CTCF-Mediated Human 3D GenomeArchitecture Reveals Chromatin Topology for Transcription ” (Cell, Vol. 163, p1611–1627, 17Dec. 2015) ,在他以前 ChIA-PET 实验基础上更进一步,在一篇文章中做了两个蛋白在四个细胞系中的 ChIA-PET( 当然实验方法有所改进 ) ,以前则是一个蛋白的 ...
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