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置顶 · 学习生物信息的第二好教程
2017-7-7 08:15
生信的作用越来越大,想学的人越来越多,不管是为了以后发展,还是为了解决眼下的问题。但生信学习不是一朝一夕就可以完成的事情,也许你可以很短时间学会一个交互式软件的操作,却不能看完程序教学视频后就直接写程序。也许你可以跟着一个测序分析流程完成操作,但不懂得背后的原理,不知道什么参数需要修改,结果可以出 ...
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单基因GSEA怎么做?
2019-8-1 11:14
今天在讨论群看到有群友提问 单基因GSEA怎么做? 。之前也看到过这个概念,但一直不清楚这个 单 是什么含义,一直以为是用 单个基因做GSEA 。如果之前看过生信宝典的 一文掌握GSEA,超详细教程 ,一定会特别熟悉 GSEA 的原理和操作流程。当然越是理解,越是想不明白 单 个基因怎么做 GSEA 。当然如果您不熟悉GSEA, ...
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挖掘PubMed数据库,获取报道的或推测新的基因调控关系
2019-5-12 14:18
生信宝典之傻瓜式推出过基于Cytoscape的插件 literature search 进行 文献挖掘查找指定基因调控网络的方 。 近来发现一款神奇的在线工具 (Chilibot, ch ip li terature ro bot ,http://chilibot.net/)可以完成同样的分析,而且看上去功能还更强大。 结果展示 采用两个关键词 cocaine 和 plasticity & ...
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Hemberg-lab单细胞转录组数据分析(九)- Scater包单细胞过滤
2019-4-22 18:30
往期系列 Hemberg-lab单细胞转录组数据分析(一) Hemberg-lab单细胞转录组数据分析(二) Hemberg-lab单细胞转录组数据分析(三) Hemberg-lab单细胞转录组数据分析(四) Hemberg-lab单细胞转录组数据分析(五) Hemberg-lab单细胞转录组数据分析(六) Hemberg-lab单细胞转录组数据分析(七 ...
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Hemberg-lab单细胞转录组数据分析(七)-导入10X和SmartSeq2数据Tabula Muris
2019-4-22 18:15
往期系列 Hemberg-lab单细胞转录组数据分析(一) Hemberg-lab单细胞转录组数据分析(二) Hemberg-lab单细胞转录组数据分析(三) Hemberg-lab单细胞转录组数据分析(四) Hemberg-lab单细胞转录组数据分析(五) Hemberg-lab单细胞转录组数据分析(六) 收藏|北大生信平台单细胞分析、染色 ...
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Hemberg-lab单细胞转录组数据分析(六)
2019-4-22 17:23
Hemberg-lab单细胞转录组数据分析(一) Hemberg-lab单细胞转录组数据分析(二) Hemberg-lab单细胞转录组数据分析(三) Hemberg-lab单细胞转录组数据分析(四) Hemberg-lab单细胞转录组数据分析(五) 收藏|北大生信平台单细胞分析、染色质分析视频和PPT分享 该如何自学入门生物信息学 ...
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Hemberg-lab单细胞转录组数据分析(五)
2019-4-22 17:21
Hemberg-lab单细胞转录组数据分析(一) Hemberg-lab单细胞转录组数据分析(二) Hemberg-lab单细胞转录组数据分析(三) Hemberg-lab单细胞转录组数据分析(四) 收藏|北大生信平台单细胞分析、染色质分析视频和PPT分享 该如何自学入门生物信息学 生物信息之程序学习 使用STAR比对read ...
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Hemberg-lab单细胞转录组数据分析(四)
2019-4-22 17:18
Hemberg-lab单细胞转录组数据分析(一) Hemberg-lab单细胞转录组数据分析(二) Hemberg-lab单细胞转录组数据分析(三) 收藏|北大生信平台单细胞分析、染色质分析视频和PPT分享 生信老司机以中心法则为主线讲解组学技术的应用和生信分析心得 - 限时免费 测序文库拆分 (Demultiplexing) 文库拆 ...
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Hemberg-lab单细胞转录组数据分析(二)
2019-4-22 17:10
单细胞测序实验方法 开发scRNA-seq的新实验方法和操作手册是目前很火的研究领域,而且最近这些年已经发表了一些改进方法。上图可以看出检测的细胞数目以指数形式增加,以下是一份不完全的列表: STRT-seq Smart-seq CEL-seq MARS-seq SCRB-seq Smart-seq2 Drop-seq ...
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Hemberg-lab单细胞转录组数据分析(一)
2019-4-22 17:04
在 别人的电子书,你的电子书,都在bookdown 一文中推荐过这一篇教程(https://hemberg-lab.github.io/scRNA.seq.course),从2016年一直更新到2018年,是入门单细胞分析的十分适合的文档。为了进一步促进学习,生信宝典申请并组织翻译这篇教程,将在公众号陆续推出。最后会有整合版以网页和PDF格式发布于易生信平台。 关于 ...
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