置顶 · 学习生物信息的第二好教程

2017-7-7 08:15

生信的作用越来越大，想学的人越来越多，不管是为了以后发展，还是为了解决眼下的问题。但生信学习不是一朝一夕就可以完成的事情，也许你可以很短时间学会一个交互式软件的操作，却不能看完程序教学视频后就直接写程序。也许你可以跟着一个测序分析流程完成操作，但不懂得背后的原理，不知道什么参数需要修改，结果可以出 ...

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赠你一只金色的眼 - 富集分析和表达数据可视化

陈同 2019-8-1 14:36

GOplot包介绍 GOplot包用于生物数据的可视化。更确切地说，该包将表达数据与功能分析的结果整合并进行可视化。但是要注意 该包不能用于执行这些分析，只能把分析结果进行可视化 。在所有科学领域，由于空间限制和结果所需的简洁性，切实地去描述事物很难，所以需要将信息进行可视化，使用图片来传达信息。精心设计的图形 ...

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单基因GSEA怎么做？

陈同 2019-8-1 11:14

今天在讨论群看到有群友提问 单基因GSEA怎么做？ 。之前也看到过这个概念，但一直不清楚这个 单 是什么含义，一直以为是用 单个基因做GSEA 。如果之前看过生信宝典的 一文掌握GSEA，超详细教程 ，一定会特别熟悉 GSEA 的原理和操作流程。当然越是理解，越是想不明白 单 个基因怎么做 GSEA 。当然如果您不熟悉GSEA， ...

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挖掘PubMed数据库，获取报道的或推测新的基因调控关系

陈同 2019-5-12 14:18

生信宝典之傻瓜式推出过基于Cytoscape的插件 literature search 进行 文献挖掘查找指定基因调控网络的方 。 近来发现一款神奇的在线工具 (Chilibot, ch ip li terature ro bot ,http://chilibot.net/)可以完成同样的分析，而且看上去功能还更强大。 结果展示 采用两个关键词 cocaine 和 plasticity & ...

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Hemberg-lab单细胞转录组数据分析（九）- Scater包单细胞过滤

陈同 2019-4-22 18:30

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Hemberg-lab单细胞转录组数据分析（七）-导入10X和SmartSeq2数据Tabula Muris

陈同 2019-4-22 18:15

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Hemberg-lab单细胞转录组数据分析（六）

陈同 2019-4-22 17:23

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Hemberg-lab单细胞转录组数据分析（五）

陈同 2019-4-22 17:21

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Hemberg-lab单细胞转录组数据分析（四）

陈同 2019-4-22 17:18

Hemberg-lab单细胞转录组数据分析（一） Hemberg-lab单细胞转录组数据分析（二） Hemberg-lab单细胞转录组数据分析（三） 收藏|北大生信平台单细胞分析、染色质分析视频和PPT分享 生信老司机以中心法则为主线讲解组学技术的应用和生信分析心得 - 限时免费 测序文库拆分 (Demultiplexing) 文库拆 ...

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Hemberg-lab单细胞转录组数据分析（二）

陈同 2019-4-22 17:10

单细胞测序实验方法 开发scRNA-seq的新实验方法和操作手册是目前很火的研究领域，而且最近这些年已经发表了一些改进方法。上图可以看出检测的细胞数目以指数形式增加，以下是一份不完全的列表： STRT-seq Smart-seq CEL-seq MARS-seq SCRB-seq Smart-seq2 Drop-seq ...

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