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Nature在线发表小麦二倍体祖先乌尔图基因组的研究论文
马省伟 2018-5-11 09:34
Nature在线发表小麦二倍体祖先乌尔图基因组的研究论文 Neal 2018.5.10 因为提前得到消息,我们今日延后更新也是为了等一等这一篇文章。凌晨1点,论文如约在线,论文是由中科院遗传发育所 梁承志、王道文、张爱民、凌宏清 等团队合作完成,文章的题目是“ Genome sequence of the progenitor of wheat A ...
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乌尔图基因组(A基因组)序列释放
马省伟 2018-5-7 12:03
乌尔图基因组(A基因组)序列释放 麦萌 2018.5.8 最近听说乌尔图基因组的文章已经接收,我就寻思着NCBI是不是已经释放了基因组序列。今天一查发现早在4.26号就已经释放,最近的4.30号还修改过。看来文章马上就要在线了。NCBI上的地址是“ https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/16746?genome_assembly_id=3736 ...
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2018年第17周小麦文献汇总(5.6)
马省伟 2018-5-5 16:29
2018年第17周小麦文献汇总(5.6) 麦萌 2018.5.6 每周日的文献推荐,就是希望大家看一看最近一周有哪些文献发表了,最主要的是希望大家不要错过自己有兴趣的文献。至于文章说了什么,我们不去评论。这里边的文献碰到我们认为比较有意思的文章,在后面的推送中会拿出来简单的解读。我们一直提倡文献要亲自读一读 ...
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小麦族多组学数据网站——设计基因组特异引物
马省伟 2018-5-4 12:06
小麦族多组学数据网站——设计基因组特异引物 昨天我们介绍了序列调取,今天我来说一说设计基因组特异引物。不过在这之前呢,还是简单的说一说我们的blast。 如下图所示可以进入,也可以直接输入网址进入 http://202.194.139.32/blast/viroblast.php 。这个网页的blast不是我们从头写的前端代码,而是来自 ...
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the plant journal:一个新的与大麦耐旱相关的microRNA
马省伟 2018-5-2 08:50
小麦族多组学数据网站——序列获取 5/2 本期作者 Neal 眨眼五一假期已过,其实很大一部分做小麦的往往没有五一假期。今天我们想要说一说与microRNA的话题。前面我们谈过一些microRNA的话题,我整理了一下列在下面,感兴趣的可以去看看,也欢迎大家就small RNA方面的内容与我们交流。 今天要谈的 ...
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小麦族多组学数据网站——序列获取
马省伟 2018-5-2 08:29
小麦族多组学数据网站——序列获取 上周我们公布了我们刚刚上线的小麦族多组学数据网站( http://202.194.139.32/ ),近一周来已有437次访问。目前网站上线的功能不多,数据也不多,但是很多地方小细节还是我们独有的。在接下来的一段时间我们会一一介绍。未来我们也希望能够和更多的老师合作,能够让小麦组学数 ...
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2018年第16周小麦文献推荐(4.29)
马省伟 2018-4-28 20:36
2018年第16周小麦文献推荐(4.29) 最近3010份水稻基因组重测序的文章在nature发表。我们小麦里除了去年plant journal上正式发表的18个小麦重测序的文章外,其他的还暂未正式发表。国内也有不少单位在进行重测序的工作。今夕不同往日,如今再开展小麦重测序工作,还除了使用基本的二代测序手段,最好还得加上 ...
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基于BSR-Seq和芯片技术构建Yr26的高密度图谱
马省伟 2018-4-28 16:28
4/ 27 本期作者:麦夕 推送了这么多篇文献,今天斗胆推送一篇我们小编自己发表的一篇文章。最近刚刚发表在Theoretical and Applied Genetics上的题为“ SNP&# ...
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小麦研究联盟倾情打造小麦族多组学数据网站
马省伟 2018-4-25 21:16
2016年4月23号,我们申请了公众号,2017年7月1号算是正式开张,至今算是开张300天。300天前,我们希望能够为小麦研究尽一份力;300天后,我们的愿望还是一样。 2017年小麦族几个主要物种的基因组陆续完成测序,尽管文章已经发表,但是目前对这些数据的利用还不是特别方便。鉴于此,我们萌生了为小麦族物种基因组建立网 ...
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PNAS经典品读-小麦春化基因(二)
马省伟 2018-4-24 14:30
4 / 24 本期作者:Meng Wang 《本草纲目》里有言:“麦,秋种冬长,春秀夏实,具四时中和之气,故为五谷之贵。地暖处亦可春种,至夏便收。然比秋种者,四气不足。”我们不谈这种理论是否准确,至少说明过冬的春化过程对于冬小麦是很关键的。 上周我们讲解了小麦春化基因 VRN1 的克隆过 ...
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