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还在race拿全长?
2018-6-6 10:50
还在race拿全长? 就小麦目前的情况来说,很多时候不需要再通过race实验拿全长了。在做race之前,我们手里拿到的序列很可能就已经是完整的序列了,甚至基因的上下游序列都是已知的。 我们都知道现在RNA-seq已经很普遍了。这些转录组数据多数是illumina平台上的产生的,少部分是454和PacBio等平台产生的 ...
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2018年第20周小麦文献汇总(6.3)
2018-6-2 22:01
2018年第20周小麦文献汇总(6.3) 1 Molecular cloning and characterization of novel WIN1/SHN1 ethylene responsive transcription factor HvSHN1 in barley (Hordeum vulgare L.). J Plant Physiol. 2018 May 28;228:39-46. doi: 10.1016/j.jplph.2018.04.019. PMID:29852333 Author : Djemal, ...
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当前植物抗病基因的九种抗病机制
2018-5-25 10:53
作者:麦夕 自上次推送抗条锈基因的克隆后,见链接。不知做抗病的小伙伴对BED-NLR的整合结构还有印象没?小编当时说要好好介绍一下目前植物抗病基因方面的研究进展。闲话少说,先抛出几篇曾较新看到的文章:分别题为 Defended to the Nines: 25 Years of Resistance Gene Clon ...
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乌拉尔图小麦里有3万个miRNA?
2018-5-22 11:24
乌拉尔图小麦里有3万个miRNA? 我们上周发了关于A基因组的解读 Nature在线发表小麦二倍体祖先乌尔图基因组的研究论文 ,后面有位小伙伴留言对我们文中提到的31,269个miRNA表示怀疑,并建议我们复查原文是否我们写错了,是mRNA,而我们写成了miRNA。这一点在阅读原文的时候我们也注意到了,并且特意查看了 ...
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在线使用乌尔图基因组
2018-5-21 12:03
在线使用乌尔图基因组 作者:Neal 群里们有一次讨论过春小麦和冬小麦的问题,包括我们宋老师也专门介绍了春小麦和冬小麦在育种上的一些应用,其中有一点印象特别深,“ 强春性小麦品种有着宽广的生态适应性 ”,这一习性的直接应用就是前面我们一直再提的speed breeding。在一次普通的聊天过程中,胖丫问我:师 ...
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2018年第17周小麦文献汇总(5.13)
2018-5-12 17:38
2018年第17周小麦文献汇总(5.13) 本周最大的惊喜当属乌拉尔图小麦基因组文章的发表。目前网站上( http://202.194.139.32/blast/viroblast.php )已经可以在线blast啦,也可以调取指定染色体区间内的基因( http://202.194.139.32/jbrowse/?data=Triticum_urartu ),更多小细节等你来发现 。 1 Char ...
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小麦叶枯病原菌无毒基因引发了寄主呈现数量遗传的抗性
2018-5-11 09:44
作者:麦夕 今天小编接上回书继续说- 小麦叶枯病原菌在致病力上呈现数量遗传性状 ,最近发表在 New Phytologist 上题为“ A fungal avirulence factor encoded in a highly plastic genomic region triggers partial resistance to septoria tritici blotch ”(在小麦叶枯病原菌基因组可 ...
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Nature在线发表小麦二倍体祖先乌尔图基因组的研究论文
2018-5-11 09:34
Nature在线发表小麦二倍体祖先乌尔图基因组的研究论文 Neal 2018.5.10 因为提前得到消息,我们今日延后更新也是为了等一等这一篇文章。凌晨1点,论文如约在线,论文是由中科院遗传发育所 梁承志、王道文、张爱民、凌宏清 等团队合作完成,文章的题目是“ Genome sequence of the progenitor of wheat A ...
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乌尔图基因组(A基因组)序列释放
2018-5-7 12:03
乌尔图基因组(A基因组)序列释放 麦萌 2018.5.8 最近听说乌尔图基因组的文章已经接收,我就寻思着NCBI是不是已经释放了基因组序列。今天一查发现早在4.26号就已经释放,最近的4.30号还修改过。看来文章马上就要在线了。NCBI上的地址是“ https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/16746?genome_assembly_id=3736 ...
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2018年第17周小麦文献汇总(5.6)
2018-5-5 16:29
2018年第17周小麦文献汇总(5.6) 麦萌 2018.5.6 每周日的文献推荐,就是希望大家看一看最近一周有哪些文献发表了,最主要的是希望大家不要错过自己有兴趣的文献。至于文章说了什么,我们不去评论。这里边的文献碰到我们认为比较有意思的文章,在后面的推送中会拿出来简单的解读。我们一直提倡文献要亲自读一读 ...
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