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今年起招收硕士生,博士生和访学学生
邵斌 2024-9-15 16:48
本人今年起招收硕士研究生,博士研究生(凝聚态物理方向, 2025年入学)以及数名访学学生(物理,数学或计算机背景)。 北京理工大学,前沿交叉科学研究院,人工智能,物理学与生物大数据交叉方向。 联系邮箱:bshao (at) bit.edu.cn 有意者请将以下电子材料发送到我的邮箱: 详细的个人简历包括学习和工作经历,主 ...
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如何配置深度学习环境:Ubuntu+TensorFlow+keras
邵斌 2017-9-19 09:59
深度学习是最近很火爆的一个技术,虽然很多概念在上个世纪就已提出,但大规模的应用和发展还是近几年的事情。这里分享一下相关配置(针对TensorFlow+keras)。 硬件需求 : 最好有一块比较新的支持cuda的NVIDIA显卡,拿cpu也可以体验深度学习,用来做研究可能就捉急了。最好有一台可以安装显卡的台式 ...
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生物中的逆向工程技术(二):参数模型
邵斌 2017-9-7 07:13
系列其他文章: 生物中的逆向工程技术(一): 线性方程 生物中的逆向工程技术 (二):参数模型 生物中的逆向工程技术 (三):布尔网络模型 生物中的逆向工程技术 (四):贝叶斯网络 生物中的逆向工程技术 (五):利用相关系数得到直接相互作用 生物中的逆向工程技术 (六):CellNet与细胞工程 ...
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生物中的逆向工程技术(四):贝叶斯网络
热度 1 邵斌 2017-9-7 06:11
基本的数学问题都可以在这篇文章里得到回答Pe'er, D. (2005). Bayesian Network Analysis of Signaling Networks: A Primer. Sci. STKE 2005(281): pl4-. 而比较原始的是这篇文献Friedman, N. (2000). Using Bayesian Networks to Analyze Expression Data. 关于贝叶斯网络比较重要的一个公式 ...
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生物中的逆向工程技术(一):线性方程
邵斌 2017-9-7 06:06
这个系列不知道为什么消失了,老文重发。 系列其他文章: 生物中的逆向工程技术(一): 线性方程 生物中的逆向工程技术 (二):参数模型 生物中的逆向工程技术 (三):布尔网络模型 生物中的逆向工程技术 (四):贝叶斯网络 生物中的逆向工程技术 (五):利用相关系数得到直接相互作用 ...
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一款表达谱数据分析的神器
热度 1 邵斌 2016-7-23 20:25
现在做生物和医学的,很多都可能会和各种组学数据打交道。其中表达谱数据总是最常用的,也是比较好测的。即使在工作中不去测序,也可以利用已有的数据库去做一些数据挖掘,找一找不同表型(比如癌症)对应的 marker 或者调控的通路。这里跟大家推荐一款分析表达谱数据的神器 GENE-E ,亲测比较好用,满足常用需求,可 ...
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winter qbio 会议掠影——学生
邵斌 2015-8-15 23:21
18 日上午开始是分区报告, 8 点钟开始。而我住的地方离酒店有几个 mile ,只能搭公交到会场。而公交每小时仅有一趟,所以我就提早出发, 7 点左右就能到会场, 18 日到 20 日都是如此。我们吃早饭的地方是一个庭院,我到的时候往往一个人都没有,约莫待了一会,服务生就过来了 。然后我吃了一会,很多人陆陆 ...
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winter qbio会议掠影 1
邵斌 2015-7-31 21:29
这篇文章本是参会回来要求提交的总结,写着写着就超字数了,删掉可惜,就发到了这里。qbio是定量生物学领域的盛会,冬季夏季各办一次,每年都能吸引众多大牛参加。冬季惯常在夏威夷,报告质量也非常高,夏季则不定。 本次会议于 2 月 16 日开始注册,我于 16 日中午做小飞机到达茂宜岛。飞机上看茂宜岛 ...
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关于Cox回归模型你需要知道的数学
邵斌 2015-3-22 21:25
生物统计技术:Kaplan-Meier生存曲线与COX回归模型 返回文章列表 Kaplan-Meier生存曲线 Kaplan-Meier生存曲线适用于对某人群进行跟踪,直至出现一个特殊事件或终点,如死亡、癌症复发等。对所有研究对象从某特定时间点开始追踪,记录出现特殊事件的时间。通常当所有研究对象出现该事件时研究才结束,但由于 ...
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生物中的逆向工程技术(六):CellNet与细胞工程
邵斌 2015-2-10 23:01
之前的一些文章被我总结在这里 生物中的逆向工程技术(一): 线性方程 生物中的逆向工程技术 (二):参数模型 生物中的逆向工程技术 (三):布尔网络模型 生物中的逆向工程技术 (四):贝叶斯网络 生物中的逆向工程技术 (五):利用相关系数得到直接相互作用 生物中的逆向工程技术 (六):CellN ...
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