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高通量测序技术及其在微生物学研究中的应用
刘华 2012-10-10 15:44
资源下载: 高通量测序技术及其在微生物学研究中的应用.pdf 高通量测序技术及其在微生物学研究中的应用,来源于: www.seq.cn
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细菌基因DNA的提取方法
刘华 2012-10-10 15:35
细菌基因组DNA的提取方法综述,提供了5种方法。 欢迎下载。 细菌基因组DNA的提取方法.pdf
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常用的Epigenomics(表观遗传学)数据
刘华 2012-9-27 17:56
DNA methylation : MeDIP和MRE是两种常用的技术,获得DNA甲基化数据; histone modification : CHIP-seq技术常用来获得组蛋白修饰数据,一般针对某一种修饰如H3K4me3,H3K4me1,H3K36me3,H3K9me3,H3K27me3等
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测序分析注意事项(一)--小心已知注释Refseq中的暗雷
热度 1 刘华 2012-9-25 14:08
测序分析注意事项(一)--小心已知注释Refseq中的暗雷
我是参照 第20120723期集结号-转录组测序分析中cufflinks的使用及问题 和 如何将几个不同的基因组注释文件合并起来 的方法进行转录组分析, 但我用中间产生的的gtf文件上传到UCSC,提示错误“ Error File 'slim.norandom.gtf' - GFF/GTF group NM_009362 on chr17-, this line is on ...
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强烈推荐-SAS9.1.3中文全功能版软件下载
刘华 2012-9-24 19:11
强烈推荐-SAS9.1.3中文全功能版软件下载 SAS_9.1.3中文全功能版,文件比较大,请使用下载工具如迅雷等下载。我已经于今日安装测试过。能用。 下载地址: http://download.pinggu.org/sas/SAS9.1.3.iso 文件大小:1.85G 本软件仅做学习交流使用,请勿用于商业用途, ...
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鉴定某一基因功能的方法大全
刘华 2012-9-20 19:33
鉴定某一基因功能的方法大全 基因功能研究的策略与方法大体内容如下: 1. 新基因的生物信息学分析: 1.1 编码产物预测分析 1.2 序列同源性分析 1.3 蛋白质功能域分析 2. 新基因的体内表达规律分析 2.1 mRNA水平的表达谱分析 2. ...
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R语言多元分析系列之:主成分分析
刘华 2012-9-20 13:48
R语言多元分析系列之:主成分分析
主成分分析 (principal components analysis, PCA)是一种分析、简化数据集的技术。它把原始数据变换到一个新的坐标系统中,使得任何数据投影的第一大方差在第一个坐标(称为第一主成分)上,第二大方差在第二个坐标(第二主成分)上,依次类推。主成分分析经常用减少数据集的维数,同时保持数据集的对方差贡献最大 ...
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microRNA相关的数据库与预测、功能分析软件
刘华 2012-9-19 10:25
原文链接 http://www.seq.cn/forum.php?mod=viewthreadtid=4212extra = miRBase: http://www.mirbase.org miRBase序列数据库是一个提供包括已发表的miRNA序列数据、注释、预测基因靶标等信息的全方位数据库,是存储miRNA信息最主要的公共数据库之一。miRBase提供便捷的网上查询服务,允许用户使用关 ...
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