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菠菜、天花板与诺贝尔奖:Karplus教授的科学传奇
热度 8 周耀旗 2024-2-1 11:00
导读:去年夏天我去波士顿访问时,拜访了我的博士后导师 Martin Karplus教授。他问我知不知道他的自传《天花板上的菠菜》(Spinach on the Ceiling),我以为他是指在综述期刊上写的同题目自述(Ann. Rev. Biophys. Biomol. Struc.35, 1-47 (2006)),便回答说,知道。第三天访问波士顿大学时,师兄John Straub告 ...
个人分类: 心得体会|5202 次阅读|9 个评论 热度 8
万圣节露面的AlphaFold3,是trick还是treat(是给糖还是捣蛋)?
周耀旗 2023-11-2 14:41
每年10月31日是西方的万圣节(Halloween),小朋友都喜欢在这个节日里打扮成各种各样的妖魔鬼怪,去邻居家门口大喊:“trick or treat (给糖还是捣蛋) ?”。今年万圣节,Google Deepmind公司联合新成立两年的、从Deepmind独立出来的公司Isomorphic Labs共同发布了新一代AlphaFold模型: AlphaFol ...
个人分类: 科技推广|3920 次阅读|没有评论
博士职业和人生规划:与周耀旗教授的座谈录(下)
周耀旗 2023-4-16 10:30
本文为深圳湾实验室博士后联谊会每月例会的主题分享内容,会议全程主要使用英语交流, 周耀旗老师首先围绕主题讲了半小时, 然后大家自由提问了问一个多小时。 以下内容经周耀旗老师和深圳湾实验室公众号编辑重新修改、翻译和整理。 问答分成三个方面:科研、职业规划、生活,分上、中、下三篇,这部分是关于生活部分 ...
个人分类: 心得体会|7456 次阅读|没有评论
博士的职业和人生规划:与周耀旗教授的座谈录(中)
热度 2 周耀旗 2023-4-15 14:39
本文为深圳湾实验室博士后联谊会每月例会的主题分享内容,会议全程主要使用英语交流, 周耀旗老师首先围绕主题讲了半小时, 然后大家自由提问了问一个多小时。 以下内容经周耀旗老师和深圳湾实验室公众号编辑重新修改、翻译和整理。 上一篇是讲话和关于 科研 方面的问答。 这部分是关于职业规划部分的 问 答(中) ...
个人分类: 心得体会|8206 次阅读|2 个评论 热度 2
博士的职业和人生规划:与周耀旗教授的座谈录(上)
热度 2 周耀旗 2023-4-11 21:35
本文为深圳湾实验室博士后联谊会每月例会的主题分享内容,会议全程主要使用英语交流, 周耀旗老师首先围绕主题讲了半小时, 然后大家自由提问了问一个多小时。 以下内容经周耀旗老师和深圳湾实验室公众号编辑重新修改、翻译和整理。 时间:2023年3月31日 主持:张哲 博士 主题:职业和人生规划 ...
个人分类: 心得体会|7277 次阅读|2 个评论 热度 2
ChatGPT来了,到底来了什么?科学家该怎么办?
热度 10 周耀旗 2023-2-12 15:33
ChatGPT 的出现,似乎颠覆了机器人回答各类问题的范围、深度和准确度,在 2 个月内用户达 1 亿,打破了抖音 9 个月破亿的记录,通过了律师、程序员、医师等考试,并且撼动了搜索公司们在搜索方法上二十多年来“躺平”的局面:微软推出了结合 ChatGPT 的 Bing ,谷歌推出 ...
个人分类: 科技推广|8938 次阅读|11 个评论 热度 10
AI的光辉还没有照亮RNA结构预测:CASP 15比赛结果详解
周耀旗 2022-12-12 19:50
导读 : RNA 结构预测可能比蛋白质结构预测更重要,因为核酸药物、靶向 RNA 小分子药物的开发都需要 RNA 结构预测;对于基础研究来说就更重要了,如果没有结构的信息来引导,我们对人体内的绝大多数非编码 RNA 都一无所知。今年暑假, CASP 15第一次对 RNA 结构预测进行了 比赛,比赛结果在今天 12月 12 ...
个人分类: 科技推广|8708 次阅读|没有评论
为什么姜还是老的辣:CASP 15蛋白质结构单体预测结果分析
周耀旗 2022-12-11 18:18
2022年最新一轮的蛋白质结构预测比赛(CASP15)的结果在12月10日-13日的会议中将陆陆续续的公开。在CASP网站上,已经公布了蛋白质单体结果预测结果的排名。前三名分别是山东大学杨建益为首的Yang-Server,密歇根大学Wei Zheng, Qiqige Wuyun,和Pete ...
个人分类: 科技推广|8023 次阅读|没有评论
痛并快乐着:蛋白质结构预测的边角故事
周耀旗 2022-7-20 10:46
导读 :2020年底,AlphaFold2在蛋白质结构预测的CASP比赛中实现了高精度预测,使得一个平时默默无闻的小众学科变成了家喻户晓的明星。 AlphaFold的成功 是结构预测这个领域多年来的量变所导致的质变。其中二个重要的量变是从预测分类转变到预测连续的边和角(原子间距离和二面角)。这里,我主要讲讲首先实现的连续 ...
个人分类: 科技推广|8780 次阅读|没有评论
切蛋白质分子,用牛刀能切出什么?
热度 2 周耀旗 2022-2-8 10:22
导读: 俗话说杀鸡不用牛刀。假如用了牛刀,无论从哪里下刀,即一刀两断,这两块也无法自我组合满血复活,除非在恐怖片里;但是如果有医生在场紧急缝合,也许可以复活。在分子生物里面,一刀切向蛋白质所形成的两段,有“医生”帮助下能够复活的叫做辅助互补片段;在恐怖片中自我复合复活的叫做自我互补片段。我们课题 ...
个人分类: 科技推广|5369 次阅读|2 个评论 热度 2

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GMT+8, 2024-4-25 22:04

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