科学网—chuchj的博文

贝叶斯随记

热度 1 储诚进 2009-9-7 09:45

很长时间没有更新博客了，不是因为懒，确实没有东西可以写。之前在这里写过几篇有关贝叶斯统计的文章，现在回头看看，当时是在很多东西都没有弄懂的情况下就动笔了（应该还没到误人子弟的地步）。最近又重新梳理了一遍，看了很多的资料，系统的学习了一遭。一周的时间，感觉收获非常大，之前很多迷糊的、不清不楚的、似是而 ...

个人分类: 生活点滴|9261 次阅读|4 个评论热度 1

光竞争与物种多样性降低 (Yann Hautier)

储诚进 2009-5-3 00:03

蒙Planta上的资源，昨天阅读了Hautier et al.（2009）Science上的文章。太熟悉这块了，以至于一口气读完。施肥之后，草地群落的多样性一般都会下降，而对于下降的原因，一直说法不一：土壤酸性提高、枯枝残留物的累计、养分资源的竞争、光资源的竞争。通常来看，土壤养分的竞争一般被认为是对称的（没有定 ...

个人分类: 生活点滴|10028 次阅读|没有评论

频度与贝叶斯――白猫黑猫？（修正版）

热度 1 储诚进 2009-5-1 21:57

频度与贝叶斯――白猫黑猫？（修正版）储诚进兰州大学以下所记，只是自己在学习贝叶斯期间的灵光闪现的心得与感受，混杂了频度统计与贝叶斯统计，或对或错，故放亮你的眼睛，呵呵。侧重于粗略的线条，具体细节未述。主要从下面几个方面，大 ...

个人分类: 生活点滴|12356 次阅读|4 个评论热度 1

个体异质性能否促进物种的共存？

储诚进 2009-4-29 09:21

关于物种共存的机制，这些年江湖上可谓是腥风血雨，不同门派尽出招数。自Hubbell中性理论的大作问世，中性派人才辈出，Nature、Science成了他们的后花园；近中性派也顺势崛起，领军人物当属北师大的张大勇老师。中性与近中性之争基本上还是门派内部的争论，本质上还是源于一宗。当群落生态学界大部分人都在中性理论上 ...

个人分类: 生活点滴|9614 次阅读|没有评论

贝叶斯在生态学中的应用举例

储诚进 2009-4-8 07:47

刚开始接触贝叶斯分析时的时候，通常都会觉得这玩意遥不可及，很玄很虚，MCMC上10000步，然后给你个结果。再加上贝叶斯的优势在于解决复杂的问题（不同来源的不确定性、随机性等），会让人感觉学习这玩意到底会有什么用处，自己以后会碰上这么复杂的问题吗？下面给出一些细小的事例，看看生态上哪些方面可以用得上： 1. ...

个人分类: 生活点滴|11471 次阅读|没有评论

贝叶斯分析在生态学中应用讨论群

储诚进 2009-4-1 11:30

QQ群号：35044310。主要内容涉及贝叶斯分析在生态学及环境学科方面的理论与应用。涉及到的主要软件为R和BUGS系列。关于贝叶斯对于生态学的意义，可以参考Ecological Applications最新（四月份）的Forum（感谢jiaojiaojing推荐）。

个人分类: 生活点滴|6268 次阅读|没有评论

WinBUGS和R在贝叶斯分析方面的细微差别

储诚进 2009-3-30 05:01

最近在做一个project。之前没有注意这个问题，因为都是随便看看，没有自己动手。这次自己动手写R代码和WinBUGS代码，问题就出来了。因为最初是从WinBUGS接触贝叶斯分析的，所以对WinBUGS语言规范更熟悉，所谓的先入为主吧。在WinBUGS中，如果你没有explicitly给出待估计参数的初始值，WinBUGS本身会从先验分 ...

个人分类: 生活点滴|10945 次阅读|1 个评论

贝叶斯state-space模型

储诚进 2009-3-20 03:34

最近在学time-series model，偶的天，这玩意真是复杂！频度方法怎么看都没懂，一会儿移动平均，一会自回归，还有方差－协方差矩阵。。。。掠过。转到贝叶斯方法，感觉好多了。贝叶斯关于时间序列的模型，是基于过程模型(process equation)和观察模型(observation equation)之上的。在每个水平上，都可以引入不确定性： ...

个人分类: 生活点滴|9843 次阅读|2 个评论

WinBUGS的内部算法（更新）

热度 1 储诚进 2009-3-17 08:55

BUGS的全称是Bayesian Inference Using Gibbs Sampling，包括WinBUGS, OpenBUGS; 以及JAGS(Just another Gibbs Sampler)，都是通过Gibbs算法来完成内部模拟的。单从名字上看，很容易让人误解为仅仅限于Gibbs。我们知道，Gibbs取样器是一个直接取样方法（direct sampling），即只是适用于那些可以figure out条件后验分布的情 ...

个人分类: 生活点滴|9076 次阅读|4 个评论热度 1

贝叶斯分析在生态学中应用

储诚进 2009-3-13 11:06

贝叶斯分析，对于生态学科来说，基本上还算是一个新鲜的东西。众所周知的，统计领域基本上可以分为两派：一是频度统计学（我们平时用的最多的，点估计、区间估计、假说检验，显著性的特点是有 P 值）；另一种就是贝叶斯统计。两种方法各有优缺点。先验概率既是贝叶斯统计的优势，也是她被人诟病最多的地方。而实际上，抛开 ...

个人分类: 生活点滴|7106 次阅读|没有评论

帐号		自动登录	找回密码
密码			注册

关闭 安全验证

chuchj

关闭安全验证