癌症：细胞发展的规模与方向的转变

热度 1 张天翼 2014-6-28 21:39

癌细胞有两个普遍的性质：分裂失控和凋亡程序失调。癌细胞是长得快又不容易死亡的细胞。与这个现象对应的分子机理是：超过 50% 的癌细胞的 Rb-E2F 途径不正常；超过 50% 的癌细胞有 P53 突变。 Rb-E2F 和 P53 分别主要调节细胞的分裂和凋亡。 当一个细胞变得分裂快、不容易死亡的时候，它的代谢也要产生相 ...

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一个用了二十年才发现有问题的重要模型

张天翼 2014-6-28 11:17

前两天发现 2007 年发表在 JCB 的一篇关于 LBK1-AMPK 调节能量依赖的细胞粘连的论文被撤销。主要问题是作者实验室去年发现用于标记果蝇卵巢突变细胞的系统有问题。这个基于 flipase/FRT 标记突变细胞的技术由 KentGolic 发明， TianXu 完善了这一套系统，相关工作发表在 1993 年 Development 。这是一项 ...

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长链非编码RNA研究领域的污点

张天翼 2014-6-20 12:37

Science 上个月声明撤销 UC Riverside Frank Sauer 实验室的两篇分别在 2004 和 2006 年发表的文章。我有些吃惊，因为自己还对 2006 年那篇文章有印象。 2006 年那篇文章主要讲长链非编码 RNA 能与蛋白结合，并参与调节基因的表达调控。这项工作是用果蝇做的，有分子机理，也有体内功能的研究结果， ...

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个体内细胞的基因组演化

热度 1 张天翼 2014-2-15 21:45

在我上大学所用的教科书告诉我 : 一个动物体内除了极少数细胞 ( 例如免疫细胞或癌细胞 ) 的基因组会变化以外，别的细胞的基因组是一样的，细胞的形状和功能的不同取决于基因表达的调节。不知道现在关于个体的基因组的保真性是如何描述的。 我们都不喜欢“盲人摸象”的研究模式，但不幸的是，在研究新事物的时候 ...

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两篇结果有矛盾的论文的不对称引用

热度 1 张天翼 2014-2-10 12:53

最近看了一些溶酶体酸化与 mTOR 方面的论文，以下两篇论文分别发表在 2011 年 Science 和 2012 年 JBC ，时间相差 7 个月。从 google 的结果来看， Science 那篇被引用了 163 次，而 JBC 那篇只被引用了 4 次。 JBC 的论文后发表，他们用了一定篇幅质疑 Science 论文的主要结果： V-ATPase ...

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生物体内的量变到质变

张天翼 2013-12-15 15:03

动物体内有很多种细胞，有“大不同”的，例如神经元和皮肤细胞，也有“小不同”的，例如神经元也分很多种。这种“小不同”在于形态或者功能上的一些细微区别，而这些“小不同”的细胞有比较近的起源。如果我们看看细胞内部，“小不同”可能反映在某些大分子或者细胞器（线粒体、内质网、溶酶体等）的数目或规模不一样。有 ...

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不一致的一半与全部（遗传学）

张天翼 2013-10-20 20:44

在遗传学研究中，很重要的一种实验是设计筛选模型来研究基因之间的相互作用。为了简化实验复杂度，很多时候研究者看 heterozygous interactions ，就是把两个等位基因的其中一个突变，而另一个是正常的，这样基本可以认为这个基因的表达量缺失了一半。因为这一类实验做起来相对简单，研究者发表了很多论文，也有一些重 ...

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Q system

热度 1 张天翼 2013-4-7 21:08

Q system是Liqun Luo实验室最近发明的一种果蝇遗传学方法，其中的QF/QUAS/QS与Gal4/UAS/Gal80有相似的特性，两个系统加在一起可以更加丰富多彩地标记果蝇细胞并且进行遗传学操作。 Liqun Luo实验室在1998年发明的 MARCM 技术是遗传学和神经生物学史上的一个里程碑。MARCM可以用于标记某种基因型的神经元，而Gal4/Gal80+Q ...

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两位Freeman

张天翼 2013-4-6 21:24

今年不去开果蝇会，看了一下大会主页上的内容。大会报告的其中一个演讲者是 MarcFreeman ，他来自 UMass Medical School ，还比较年轻，是搞神经生物学的。我以前搜索 FreemanM 的时候，偶尔会看见他的工作，而我真正想找的人是 MatthewFreeman 。 Matthew Freeman 的实验室在剑桥 MRC ，主要用果蝇为 ...

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