医学疾病的易感性差异

热度 1 陈俭海 2021-8-22 12:27

疫病的易感性差异，是一个很常见的医学遗传学问题。 不同社会阶级、种族、年龄、性别、组织器官、细胞类型，疾病的易感性、症状都不一定一模一样。 对不同民族来说，容易感染的疾病都不尽相同。原因主要是跟民族起源以及“始祖效应”（founder effect）有关。所谓“始祖效应”，简单来说，就是祖先含有某一些易 ...

3709 次阅读|3 个评论 热度 1

GATK4的新功能GenomicsDBImport

陈俭海 2020-10-9 15:09

研读GATK最佳实践的研究者可能被以下描述所吸引： Prior to GATK4 this was done through hierarchical merges with a tool called CombineGVCFs. This tool is included in GATK4 for legacy purposes, but performance is far superior when using GenomicsDBImport, which produces a datastore instead of a GVCF fi ...

5838 次阅读|没有评论

全外显子测序分析流程中，什么时候加入外显子区间文件

陈俭海 2020-9-29 23:09

When should I restrict my analysis to specific intervals? This document covers the reasoning behind the use of genomic intervals. If you're looking for instructions on how to use intervals in practice, including argument details and supported formats, please see this doc . ...

2955 次阅读|没有评论

适应度和选择系数

陈俭海 2016-11-17 14:16

加入三个基因型的存活子代数目是： 基因型: A 1 A 1 A 1 A 2 A 2 A 2 后代数： 10 5 &nbs ...

5104 次阅读|没有评论

reseq数据分析

陈俭海 2015-3-13 21:29

reseq数据分析之一： aspera+sra 发现网上ncbi 的aspera安装教程不完整，特此补充。 建议下载sra用aspera，此程序下载速度惊人。可以挤占宽带，基本上有这一个程序，其他的wget就从top界面消失了。 1. 进入linux服务器。 输入：wget http://downloads.asperasoft.com/download/sw/connect/3.1/aspera-connect-3. ...

8636 次阅读|没有评论

本页有 1 篇博文因作者的隐私设置或未通过审核而隐藏