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2016年3月,作为BMKCloud公共数据库项目的一部分,动物、植物、微生物高通量测序数据库正式上线。百迈客云的合作伙伴现在可以在BMKCloud上免费访问三大数据库了。在BMKCloud上将PB规模的高通量测序数据作为共享资源,用户无需下载数据,直接在BMKCloud上利用分析平台进行分析,加速了利用公共数据进行研究和探索的步伐。
随着测序数据爆炸式增长、测序价格急剧下降,科研工作者面临的问题不再是价格因素,而是如何高效地利用数据。nature reviews genetics报道称,目前已发表的高通量测序数据利用率不足20%,很多有价值的信息被研究者所忽略,基于公共数据挖掘和分析将成为科学研究发展的趋势。最有代表性的是最大的癌症基因信息的数据库,Cancer Genome Atlas/TCGA蕴藏着难以想象的宝贵信息,围绕TCGA已经有很多重量级文章出现,Pubmed收录的利用其进行数据挖掘发表的文章已经超过1500篇,而且对它的使用必然愈发重要。BMKCloud公共数据库项目建立的目的也是让科研工作者更高效、更快速的利用公共数据,提高公共数据的利用效率。使大数据的挖掘不仅仅局限于癌症的研究,能够在动物、植物、微生物等研究中都得到很好的利用。
BMKCloud公共数据库项目的目标是建立植物、动物、细胞系、微生物、宏基因组、疾病高通量测序数据库以及肿瘤高通量测序数据库。目前,动物、植物、微生物高通量测序数据库正式上线。每个数据库中都收集和整理了全世界公开发表的各个物种高通量测序的原始数据及相关论文,为开展各个领域的研究提供准确,全面,最新的二代测序原始数据和相应文献的整合检索平台。
BMKCloud公共数据库项目的数据来源是NCBI的SRA等高通量测序的公共数据,数据来源可靠,涵盖重测序、转录组等各个研究领域(已水稻为例,目前已收录的基因组数据集29910个,转录组数据集2100个);所有数据已存储在BMKCloud服务器,用户无需下载,所有数据均可一键导入我的数据中保存,数据是fastQ格式文件。可以方便地应用BMKCloud分析平台和工具进行数据分析和研究;根据物种、疾病类型、研究性状、研究结果、测序方法等设置了快速检索,用户可以更快速地检索到感兴趣的数据;数据库有专人负责更新,不断地收录已公开的高通量测序数据。
对基因组学而言,云已经成为如何进行科学研究的新标准。百迈客云(BMKCloud)是一个基于基因大数据的挖掘,管理和科研协作的整合平台,可以使不具备生物信息分析基础的用户,快速掌握独立的生物信息分析能力,实现高通量数据的深度解读。百迈客云提供:10大生物信息分析平台(重测序、外显子、转录组、非编码RNA等),基本分析+个性化分析,轻松实现原始数据到生物学问题准确解读的转化;143款数据分析工具,涵盖数据处理,文件操作,序列比对,基因注释和图表制作等,满足常规数据分析需求。百迈客云已经成为进行基因大数据的分析的最佳选择。Archiver|手机版|科学网 ( 京ICP备07017567号-12 )
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