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研究背景:
植物产量受干旱的影响较大。随着全球变暖,植物的抗旱性研究十分迫切。研究复杂数量性状与干旱互作的分子机理以及相关基因,将有利于培养出适应性广、产量高的生产品种。
研究方法:
选取芜菁的RIL群体(F7),随机分为两组处理,一组为对照,一组为干旱处理,重复三次(三个区组),测生理生态表型数据,估计表型的BLUP值作为QTL定位的表型。用GenStat多性状多环境QTL定位模型,估计QTL X E 互作,找到不同类型互作的QTL位点。
应用GenStat软件中的模型:
1、BLUP估计:每组处理有三个区组,将品种和区组作为随机因子,估计方差组分和BLUP,计算遗传率:
模型如下图:
01
2、表型相关显著性测验:
3、QTL定位
4、G X E
5、聚类分析
研究结果
1、对20个表型数据进行QTL定位,共定位到54个相关QTL
2、对54个QTL进行聚类,可划分为11类
3、17个QTL显示与环境互作达到极显著水平
4、根据表型关联分析的结果,将QTL与环境互作的QTL定位到第七条染色体上
参考文献
Mohamed El-Soda,Martin P. Boer, Hedayat Bagheri, et al. Genotype–environmentinteractions affecting preflowering physiological and morphological traits ofBrassica rapa grown in two watering regimes [J]. Journal of ExperimentalBotany, 2014.
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