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核酸浓度的定量

已有 8837 次阅读 2007-10-7 19:24 |个人分类:生命科学—实验技术

从细胞内抽取核酸主要用于Southern blotting,DNA hybridization及在载体内构筑核酸基因,并作遗传形质转殖、表现的鉴定。使用在这些过程中的核酸的量过与不及均不适宜,因此了解所抽取组织中核酸的量,即可在使用上免去此一困扰。一般完成核酸抽取后,常随即测量其含量,并检测抽取之核酸纯度,作为上述分析过程的参考。
 
试剂和器具:
1.    微量离心管
2.    TE buffer:稀释DNA用(亦可用无菌水来代替)
3.    分光光度计专用之石英比色管(Quartz cuvette)
 
仪器和设备:
1.    分光光度计(UV spectrophotometer)
2.    4冰箱
3.    震荡器
4.    离心机
5.    -20冰箱
 
步骤:
1.    将分光光度计打开,热机至少20分钟。
2.    将DNA溶液中取2-5µl,加TE buffer(或纯水)使体积成为1000µl。
3.    将稀释之DNA溶液倒入石英管,以TE buffer(或纯水)为标准倒入另一管。
4.    在波长230-300nm间进行扫瞄,光光度会收图谱及吸收值。
5.    比较在260nm及280nm之读值。
A260/A280>1.7-1.8表示DNA/RNA的纯度高。
A260/A280<1.7表示DNA/RNA的纯度不高,可能需再做一次纯化。
 
浓度计算(Spectrophotometric conversions):
1 A260 unit of double-stranded DNA = 50μg/μl
1 A260 unit of simgle-stranded DNA = 33μg/μl
1 A260 unit of simgle-stranded RNA = 40μg/μl
 
1.    DNA : 测定样品中的DNA浓度规定为50μg/ml
因此,若由DNA原液取5μl稀释成1000μl (即1 ml),而A260读值为0.18
,则此稀释样品的DNA浓度(μg/μl)为:
                        0.18 ×50μg/ml = 9μg/ml
稀释DNA样品中的含量为9μg/ml ×1ml = 9μg---此为每5μl DNA原液
所含有的量,因此原液中的DNA浓度(μg/μl)为:
                        9μg ÷5μl = 108μg/μl
 
2.    RNA : 测定样品中的RNA浓度规定为40μg/ml (RNA通常为单股)
因此,若由RNA原液取5μl稀释成1000μl (即1 ml),而A260读值为0.18
,则此稀释样品的RNA浓度(μg/μl)为:
                            0.18 ×40μg/ml = 7.2μg/ml
稀释RNA样品中的含量为7.2μg/ml ×1ml = 7.2μg---此为每5μl RNA原液所含有的量,因此原液中的RNA浓度(μg/μl)为:
                            7.2μg ÷5μl = 1.44μg/μl
 
注意事项 :
通常OD260/OD280>1.8表示纯化之核酸的纯度很高,而蛋白质含量很少。如果
OD260/OD280<1.5表示纯化之核酸溶液中含有50%蛋白质及50%DNA。因此最好将前述所得DNA原溶液再重新抽取。
 
结果:
                 sample 1                sample 2
(1)       A260: 0.287          (1)A260: 0.242
(2)       A280: 0.307          (2)A280: 0.224
(3)       Ratio: 0.935          (3)Ratio: 1.080
     sample 1与sample 2 的DNA纯度皆不高。
 
讨论:
1、可能做Genomic DNA分离的步骤未做好,如上清液未吸干净,可能残留RNA、蛋白质或多醣类、杂质等。
2、倒掉滤液未倒干净,仍残留其它物质。
3、微量吸管有污染到,而上下吸取混合时未做好及加入的药剂量未完全正确。
 
 


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