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在谈化合物的手性的时候,
先谈谈chirality和parity的区别
chirality是化学中所说的手性
parity翻译为宇称,新规则下的手性
Parity is a general type of specification of chirality.
计算机中对手性原子的重新定义。
parity和chirality都和顺时针逆时针有关
顺时针parity的值为1,逆时针值为2,非手性碳为0,手性不确定为3
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chrality 顺时针值为R,逆时针值为S,
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重点
chrality 判断手性是基于原子量的大小,把最小的原子远离你,比如H原子。
然后是相连原子最大的原子编为1号。采用BFS的策略比较找出1 2 3对应的原子,看1 2 3 的顺序
parity基于原子在分子中的序号,把序号最小的原子远离你,然后序号最大的原子编写为1,其次为2,比较123的顺序。
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Now, the three atoms forming the plane may arrange
either clockwise, in which case the local parity of the stereo center is called ODD,
or counterclockwise, in which case the local parity of the stereo center is called EVEN.
#ref:http://www.chemaxon.com/marvin-archive/6.1.5/marvin/help/sci/parity.html
#ref: Description of several chemical structure file formats used by computer programs developed at Molecular Design Limited
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举例子
1同为S的分子,手性中心碳原子parity可能为1也可能为2
1同为S的分子,手性中心碳原子parity可能为1
分析
2同为S的分子,手性中心碳原子parity可能为2
分析:
总结:
parity只能表明原子具有手性,paity的数值和RS不存在对应关系,
parity取决于原子编号,最大的远离,然后升序比较
chrality表征原子的RS,分子量最小的远离,然后按照分子量降序比较方向,
取决于分子量。2D分子表征手性是通过锲形键,
6代表向内的锲形键
1代表向内的锲形键
0代表普通键。
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GMT+8, 2024-9-27 10:26
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