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当今世界,除娱乐及流行界外,发展和变化最快的就是科技界。科技的高速发展催生了一批又一批新词汇,但这些新词形式上不是别造新词,而是旧词别赋新义,所谓“旧瓶装新醋”。这些新词的意思,即便收录最快的网上词典也来不及收录。
比如基因组或转录组测序中的几个词:kmer、read、contig和Scaffold。据《基因测序中的kmer是什么意思_百度知道》,Kmer:具有指定长度为K (such as K=17)的DNA序列。据《高通量测序中,read、contig和Scaffold分别是什么?_美吉生物_新浪...》,高通量测序平台产生的序列就称为reads;拼接软件基于reads之间的overlap区,拼接获得的序列称为Contig(重叠群);基因组de novo测序,通过reads拼接获得Contigs后,往往还需要构建454 Paired-end库或Illumina Mate-pair库,以获得一定大小片段(如3Kb、6Kb、10Kb、20Kb)两端的序列。基于这些序列,可以确定一些Contig之间的顺序关系,这些先后顺序已知的Contigs组成Scaffold。
另见:
高通量测序领域常用名词解释大全解决方案 - 生物服务在线 ...
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GMT+8, 2024-9-27 10:37
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