getseqfromirgspv4_primers.pl

      利用MySQL数据库来储存序列，通过perl脚本获取序列，并进行引物设计。当然除了引物设计干其它事情也是可以的。

      将FASTA文件导入MySQL数据库的方法：

bp_seqfeature_load.pl -c -f -a DBI::mysql -d volvox volvox_all.fa volvox_all.gff3

     其中-d 后的volvox为MySQL中新建的数据库名，volvox_all.fa为fasta序列文件，volvox_all.gff3为gff3格式的序列注释文件。这两个文件可以全部提供，也可以提供其中的一个，当然也可以提供多个。

    要熟悉bp_seqfeature_load.pl的用法，用命令:bp_seqfeature_load.pl -help.

    当然还有些前提条件:比如安装MySQL,和Bioperl,使用的系统为LINUX。

    如果只有一条序列要进行引物设计，那也不需要什么脚本了，随便找个什么引物设计软件就可以完成，但如果需要成批的处理，那就得写脚本了。

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刚运行的命令：

# bp_seqfeature_load.pl -c -f -a DBI::mysql -d bgi2010seq 9311* -u root -p ysy76972001