(2) 完整的病毒：Bacteriophage phiX174, Poliovirus and Rhinovirus, Dengue Virus, Parvoviruses, Adenovirus, & Tobacco Mosaic Virus

　　Bacteriophage phiX174（噬菌体phiX174）http://dx.doi.org/10.2210/rcsb_pdb/mom_2000_2 

　－数据库中第一万个结构 1cd3 ，420 chains、超过五十万个原子

　－二十面体 (icosahedron) 对称性：7 × 60

　－不包括DNA结构

　　Poliovirus（脊髓灰质炎病毒）and Rhinovirus（鼻病毒）http://dx.doi.org/10.2210/rcsb_pdb/mom_2001_8 

　－属细小核糖核酸病毒 (Picornavirus)，还包括口蹄疫病毒

　－脊髓灰质炎病毒：仅3种型，胃肠型流感症状，一次感染终身免疫，约1%概率入侵神经系统致病

　　[图] 脊髓灰质炎病毒结合受体（入侵）1dgi ；结合抗体片段（被识别）1rvf。

　－鼻病毒：多型、可反复感染，简单、生命力强。很多与药物分子结合的结构可得

　　Dengue Virus（登革病毒）http://dx.doi.org/10.2210/rcsb_pdb/mom_2008_7

　－RNA病毒，编码10个蛋白（3结构蛋白）

　－最外为3个结构蛋白 × 180 1k4r

　－进入细胞后遇溶酶体酸性环境，改变四级结构 1ok8 ，尖端疏水残基插入溶酶体膜完成RNA释放

　－有四型，难发展疫苗

　－非结构蛋白包括甲基转移酶、聚合酶、蛋白水解酶、解旋酶

　　Parvoviruses（细小病毒）http://dx.doi.org/10.2210/rcsb_pdb/mom_2010_5

　－可发生病毒进化 (viral emergence)，1970年代末期猫瘟病毒（feline panleukopenia virus）1fpv 发生几个点突变，可以感染狗 2cas [图]

　－进攻转铁蛋白 (transferrin) 受体

　－人细小病毒 1s58 可引起5号病

　－比核糖体稍大，DNA病毒

　　Adenovirus（腺病毒）http://dx.doi.org/10.2210/rcsb_pdb/mom_2010_12 

　－对免疫系统正常的成人、婴儿无害，用于治疗基因疾病、癌症和运输疫苗

　－结构复杂：240个三条相同链组成的六边形、12个5条相同链组成五边形在二十面体顶点、顶点伸出3条相同链组成的长纤维

　－纤维与细胞表面蛋白结合、内吞作用进入细胞、与整合素结合囊泡破裂

　－由于会被免疫系统清除，无法做长期治疗。

　　Tobacco Mosaic Virus（烟草花叶病毒）http://dx.doi.org/10.2210/rcsb_pdb/mom_2009_1 

　－第一个发现（分离得到）的病毒

　－螺旋状，编码4个蛋白（2 DNA复制、1 RNA运输、1衣壳）的RNA被蛋白质包裹，非常稳定

　－在细胞内衣壳必须除去才能发生感染：衣壳蛋白的酸性氨基酸在细胞内无钙离子环境下相互排斥，排列松动

　－病毒组装过程复杂：两层每层17个衣壳蛋白的螺旋首先形成，RNA特定序列结合其上，变为每层16又1/3个衣壳蛋白的螺旋，更多衣壳蛋白再结合上去。可确保只有病毒RNA能够结合

　－RNA与衣壳蛋白的结合：3个碱基结合1个蛋白