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R 语言中折线图下带有柱形图的做法

已有 27955 次阅读 2014-5-13 20:42 |个人分类:R 语言|系统分类:科研笔记| R语言, 作图

   前几天帮同事作一幅统计图,要求折线图下带有柱形图。折线图描绘四组指标随着时间的变化,柱形图用来给出各个时间点不同组别的显著性标记。之前一直用 SPSS 和 Excel 作图,但是两种类型的图形合成在一块似乎不太好弄。试着用 R 语言画了一下,结果还看得下去。现将代码记录如下,方便以后粘贴使用。

library(ggplot2)

graph1 <- ggplot(data = data1, aes(x = factor(day), y = mean)) +
 geom_line(aes(group = group)) + #线图
 geom_point(
aes(shape = group), size = 3) + #点图
 geom_bar(aes(y = me
an/2, fill = group), colour = "black",
          position = "dodge") + #柱形图
 geom_errorbar(aes(ymax = mean/2 + se/2, ymin = mean/2, group = group),
               width = 0.2, position = position_dodge(0.9)) + #柱形图上误差棒
 geom_linerange(aes(ymax = mean + se, ymin = mean)) + #折线图上误差竖线
 geom_segment(aes(x = time - 0.05, xend = time + 0.05,
                  y = mean + se, yend = mean + se)) +
#折线图上误差横杠
 geom_text(aes(y = mean/2 + se/2 + 3, label = note, group = group),
           position = position_dodge(0.9),
           size = 5, fontface = "bold") + #柱形图上显著性标记
 scale_fill_manual(values = c("black", "#525252", "#cccccc", "white"),
                   labels = c("Ber Con", "Ber SE",
                              "Qyuan Con", "Qyuan SE")) + #填充灰色阶
 scale_shape(labels = c("Ber Con", "Ber SE",
                        "Qyuan Con", "Qyuan SE")) + #设置点图例
 scale_x_discrete(labels = paste(c(0, 3, 5, 8, 12), "day", sep = "")) +
 labs(shape = "line", fill = "bar", x = NULL,
      y = "Body weight (g)") + #坐标轴标签
 theme_bw() + theme(panel.grid = element_blank(),
                    legend.text = element_text(size = 15),
                    axis.title = element_text(size = 20),
                    axis.text = element_text(size = 15),
                    legend.title = element_text(size = 15)) #白色主题
ggsave(plot = graph1, filename = "0graph1.jpeg", width = 34.29, height = 15.84, units = "cm")

   做出来的图形如下:




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